О факультете
Факультет биологии клетки ПущГЕНИ образован в 1995 году для подготовки научных кадров высшей квалификации по биологии клетки, физико-химическим механизмам функционирования клеток и клеточных систем.
Научно-производственная стажировка студентов и аспирантов проходит в лабораториях на базе Института биофизики клетки РАН (ИБК РАН)., оснащенных современным оборудованием, позволяющим освоить разнообразные биофизические и биохимические методы исследования.
Основные направления научных исследований
- Рецепция и внутриклеточная сигнализация: молекулярные механизмы передачи сигнала в сенсорных, иммунных, нервных и других клеточных системах.
- Механизмы клеточного стресса. Гибернация. Криоконсервация клеток. Клеточная инженерия. Создание генетического криобанка редких и исчезающих видов живых существ.
- Механизмы действия электромагнитных и акустических полей, а также ионизирующих излучений на клетку и клеточные системы.
- Исследование структуры и функциональных свойств биомолекул. Конформационная подвижность биополимеров. Принципы стабилизации структуры белков и надмолекулярных комплексов.
- Медицинские аспекты клеточной биологии. Молекулярные механизмы клеточных патологий. Поиск средств их диагностики и коррекции.
Магистерская образовательная программа состоит из уникальных авторских курсов лекций, составленных преподавателями, осуществляющих многолетнюю научно-исследовательского работу.
Преподавательский состав факультета включает в 6 докторов и 11 кандидатов наук.
Широкий набор дисциплин, преподаваемых в учебном центре, позволяет гибко подойти к обучению магистрантов, учитывая различную степень их базовой подготовки в области биологии.
Студенты, прошедшие подготовку на факультете, получают фундаментальное физическое и биологическое образование в области молекулярной и клеточной биологии и практические знания в области аппаратуры и методов молекулярных и клеточных исследований, а также углубляют знания в области информатики и иностранных языков.
Ежегодно магистранты и аспиранты факультета биологии клетки становятся стипендиатами областных и российских стипендиальных программ: Стипендия Правительства Российской Федерации, Стипендия Президента Российской Федерации, Стипендия «Подмосковье», Грант губернатора Московской области, а так же побеждают на различным российских и международных научных конкурсах, включая «У.М.Н.И.К.» и «Старт».
Ежегодно магистранты и аспиранты вовлекаются в выполнение работ в лабораториях ИБК РАН, а так же оказываются автоматически вовлечёнными в систему грантовой поддержки лаборатории и систему межлабораторного научного сотрудничества, в том числе и международного.
Трудоустройство
Магистранты совмещают процесс обучения с научно-исследовательской работой в лабораториях. По окончании магистратуры выпускники имеют преимущество при поступлении в аспирантуру ПущГЕНИ или РАН. По окончании магистратуры и аспирантуры выпускников приглашают на работу ведущие в этой области научно-исследовательские институты, предприятия и профильные фирмы.
Выпускники могут работать:
- В научно-исследовательских институтах, занимающихся фундаментальными проблемами клеточной биологии и физиологии организмов, использующих современные физические методы исследования биологических систем
- В учреждения и предприятия биотехнологического, медицинского и фармацевтического профиля
- В медицинские учреждения, использующие электромагнитные поля в диагностических и лечебных целях.
Полученные знания и уникальный опыт делают выпускников конкурентоспособными кадрами для поиска работы в научно-исследовательских и наукоемких организациях всего мира. Результатом этого является почти 100% трудоустройство наших выпускников.
Наука
Основные направления исследований
- Рецепция и внутриклеточная сигнализация: молекулярные механизмы передачи сигнала в сенсорных, иммунных, нервных и других клеточных системах.
- Механизмы клеточного стресса. Гибернация. Криоконсервация клеток. Клеточная инженерия. Создание генетического криобанка редких и исчезающих видов живых существ.
- Механизмы действия электромагнитных и акустических полей, а также ионизирующих излучений на клетку и клеточные системы.
- Исследование структуры и функциональных свойств биомолекул. Конформационная подвижность биополимеров. Принципы стабилизации структуры белков и надмолекулярных комплексов.
- Медицинские аспекты клеточной биологии. Молекулярные механизмы клеточных патологий. Поиск средств их диагностики и коррекции.
Достижения, значимые открытия, изобретения:
Впервые зарегистрировано распространение Са2+ - волны в невозбудимых клетках, сопряженное с секрецией АТФ и обеспечивающее согласованное поведение клеточной популяции в ответ на стимуляцию определенных рецепторов. Этот тип межклеточной коммуникации носит универсальный характер и играет важную роль в регуляции функционирования клеток и тканей.
Обнаружен и охарактеризован новый белок-антиоксидант обонятельного эпителия – пероксиредоксин VI. Исследованы основные антиоксидантные свойства, выявлена иерархия в общей системе ферментов-антиоксидантов в организме животных. Показан высокий терапевтический эффект при использовании рекомбинантных пероксиредоксинов VI при лечении острых воспалительных процессов и ран, что позволяет создать новый класс терапевтических препаратов антиоксидантного действия.
Построена карта распределения элементов, которые могут быть вовлечены в регуляцию экспрессии генов в клетках E . coli . Выявлены гены, с кодирующих участков которых, кроме мРНК, может идти синтез антисмысловых или альтернативных (укороченных) РНК-продуктов.
Общее число патентов за последние 5 лет – 9.
Лабораторная база:
- Спектрофотометр CARY 100, Вариан, Австралия
- Система для хроматографического разделения белков Acta Purifier 100 (GE Pharmacia, США)
- Ультразвуковой дезинтегратор Sonicator-4000 (Misonix, США)
- Двухлучевой сканирующий спектрофотометр Evolution 600 (190-900нм, Thermo Scientific, USA)
- Флуоресцентный сканирующий спектрометр Lumina (190-900нм, Thermo Scientific, USA)
- Лазерный сканирующий конфокальный микроскоп Leica TSC SP5 (Leica, Germany)
- Исследовательский микроскоп Leica DM6000B (Leica, Germany)
- Исследовательский микроскоп Axio Observer (Carl Zeiss, Germany)
- Исследовательский микроскоп Axio Imager (Carl Zeiss, Germany)
- Моторизованный стереомикроскоп Leica MZ 16A (Leica, Germany)
- Конфокальные сканирующие микроскопы LSM 510 фирмы Карл Цейс, и фирмы TCS SP5Leica.
- Высокоскоростная флуоресцентная станция AF 6000 (Leica)
Коллекция биологического материала «Экспериментальный генетический криобанк»
В 1978 году профессором Б.Н. Вепринцевым были разработаны основные положения «Программы сохранения генетических ресурсов методами криоконсервации».
1980 г. Создана группа по криоконсервации геномов животных на базе «лаборатории биофизики клетки» («лаборатория криобиологии и биофизики воды»).
4 октября 2013 года приказом №225-н (чл.-корр. Е.Е.Фесенко) в целях повышения эффективности научных исследований и организации взаимодействия с российскими и зарубежными научными и научно-образовательными учреждениями на базе имеющегося в институте биофизики клетки криобанка образцов клеток и тканей редких и исчезающих видов животных и растений, создана коллекция биологического материала «Экспериментальный генетический криобанк ИБК РАН».
Основные преподаватели, руководители научных направлений:
Зинченко Валерий Петрович, д.б.н.
Основные направления научных исследований:
- Биофизические аспекты функционирования клетки. Механизмы рецепции и внутриклеточной сигнализации в различных типах клеток
- Медицинские аспекты физиологии клетки и клеточной биофизики. Разработка подходов к созданию новых медицинских препаратов, к диагностике и лечению различных заболеваний».
Финансируемые в настоящее время проекты:
- Клеточные и молекулярные механизмы развития нейродегенерации при болезни Паркинсона и дофамин-индуцированной нейрональной гибели.
- Разработка оптических методов поиска и биотестирования новых лекарственных препаратов агонистов и антагонистов рецепторов NMDA, AMPA, KA, ГАМКА-, CB1, 5HT1, ССK2, корректирующих психоэмоциональное состояние человека.
- Исследование механизмов функционирования гиппокампа и связанных с ним структур мозга в норме и патологии. Разработка способов предотвращения и компенсации нарушений центральных функций.
- Исследование механизмов глобальной сигнальной недостаточности при ожирении, метаболическом синдроме и диабете II типа. Способы предупреждения ожирения. Механизмы токсического действия насыщенных жирных кислот на клетки сердечно-сосудистой системы, мозга и печени при острых печеночных энцефалопатиях.
- Изучение регуляции липидной буферной емкости адипоцитов человека пептидными гормонами CCK, ANP и AngII в норме, при ожирении и диабете 2-го типа. Рецепторы, сигнализация, механизмы регуляции липогенеза и липолиза в адипоцитах. Анализ механизмов и разработка протекторов печеночных энцефалопатий.
- Разработка лекарственных средств на основе природных метаболитов, обеспечивающих повышение работоспособности при экстремальных физических нагрузках, ускорение восстановления и уменьшение болевого синдрома путем модуляции клеточных сигнальных систем.
Озолинь Ольга Николаевна, д.б.н. проф.
Основные направления научных исследований:
моделирование структурной организации бактериальных промоторов и поиск их в бактериальных геномах; использование сигналов транскрипции для идентификации мест кодирования новых РНК-продуктов в геноме E.coli, включая антисмысловые, альтернативные и малые нетранслируемые РНК; анализ факторов, ответственных за дифференциальную экспрессию индивидуальных генов и их регуляцию; изучение молекулярно-генетических механизмов возникновения стрессовых состояний у разных видов организмов (температурный шок, развитие гибридного дисгенеза); характеристика белков, индуцируемых в условиях стрессовых состояний; клонирование генов теплового шока
Бобкова Наталья Викторовна, к.б.н.
Основные направления научных исследований:
изучение клеточных и системных механизмов функционирования головного мозга и информационных процессов в нем, влияние различных физических факторов на деятельность мозга, изучение волновых механизмов в возбудимых тканях; исследование клеточных механизмов памяти в норме и при развитии патологического процесса на животных моделях нейродегенеративных заболеваний (болезнь Альцгеймера и рассеянный склероз). Нейрогенез в мозге. Экспериментальная разработка подходов к ранней диагностике и лечению перечисленных заболеваний.
Винокуров Максим Григорьвич, д.б.н.
Лаборатория участвует в исследованиях по теме плана Института биофизики клетки РАН: "Механизмы клеточного стресса. Влияние физических и химических факторов на клетки и организмы".
Основные направления научных исследований:
- Изучение молекулярных механизмов апоптоза клеток человека и животных при действии апоптоз-модулирующих факторов различной природы в норме и при патологиях;
- Исследование молекулярных механизмов действия белка теплового шока БТШ70 на миелоидные клетки при действии липополисахаридов разной структуры;
- Роль липидов органелл клеток печени и неокортекса (митохондрий, эндоплазматического ретикулума и ядер) в адаптации млекопитающих к естественному (зимняя спячка) и искуственному гипобиозу;
- Участие полиаминов тканей в зимней спячке и в устойчивости млекопитающих к искусственному гипобиозу.
Кондратьев Максим Сергеевич, к.ф.-м.н.
Основные направления научных исследований:
- Исследование молекулярного механизма функционирования бактериородопсина;
- Исследование механизмов стабилизации пространственной структуры глобулярных белков;
- Развитие физических представлений о структурном полиморфизме молекулы ДНК;
- Исследование механизма фолдинга олигопептидных последовательностей.
Колесников Станислав Сергеевич, д.б.н., проф.
Основные направления научных исследований:
- Изучение сигнальных процессов, протекающих в клетках при их возбуждении.
1) изучение рецепторных систем и сопряженных сигнальных каскадов
2) изучение ионных каналов, вовлеченных в сигнальные процессы)
3) изучение профиля экспрессии рецепторных, канальных и других сигнальных белков)
4) математическое моделирование сигнальных и транспортных процессов
- Реконструкция клеточных компонент в модельных системах.
1) клонирование сигнальных и канальных белков и их исследование в гетерологичной системе
2) исследование бактериальных токсинов и других мембранотропных соединений в модельных липидных мембранах - 3) разработка биосенсоров
Исследование механизмов молекулярного узнавания:
1) изучение белок-белкового взаимодействия методами молекулярного моделирования и молекулярной графики;
2) анализ взаимодействия рецептор-лиганд методами физической и вычислительной химии)
Впервые зарегистрировано распространение Са2+ - волны в невозбудимых клетках, сопряженное с секрецией АТФ и обеспечивающее согласованное поведение клеточной популяции в ответ на стимуляцию определенных рецепторов. Этот тип межклеточной коммуникации носит универсальный характер и играет важную роль в регуляции функционирования клеток и тканей.
Обнаружен и охарактеризован новый белок-антиоксидант обонятельного эпителия – пероксиредоксин VI . Исследованы основные антиоксидантные свойства и выявлена иерархия этого белка в общей системе ферментов-антиоксидантов в организме животных. Показан высокий терапевтический эффект при использовании рекомбинантных пероксиредоксинов VI при лечении острых воспалительных процессов и ран, что позволяет создать новый класс терапевтических препаратов мощного антиоксидантного действия.
Построена карта распределения элементов, которые могут быть вовлечены в регуляцию экспрессии генов в клетках E . coli . Выявлены гены, с кодирующих участков которых, кроме мРНК, может идти синтез антисмысловых или альтернативных (укороченных) РНК-продуктов.
Общее число патентов ИБК РАН за последние 5 лет – 9.
10 лабораторий института задействовано в научно-образовательном процессе.
Лабораторная база:
- Спектрофотометр CARY 100, Вариан, Австралия
- Система для хроматографического разделения белков Acta Purifier 100 (GE Pharmacia, США)
- Ультразвуковой дезинтегратор Sonicator-4000 (Misonix, США)
- Двухлучевой сканирующий спектрофотометр Evolution 600 (190-900нм, Thermo Scientific, USA)
- Флуоресцентный сканирующий спектрометр Lumina (190-900нм, Thermo Scientific, USA)
- Лазерный сканирующий конфокальный микроскоп Leica TSC SP5 (Leica, Germany)
- Исследовательский микроскоп Leica DM6000B (Leica, Germany)
- Исследовательский микроскоп Axio Observer (Carl Zeiss, Germany)
- Исследовательский микроскоп Axio Imager (Carl Zeiss, Germany)
- Моторизованный стереомикроскоп Leica MZ 16A (Leica, Germany)
- Конфокальные сканирующие микроскопы LSM 510 фирмы Карл Цейс, и фирмы TCS SP5Leica.
- Высокоскоростная флуоресцентная станция AF 6000 (Leica)
Коллекция биологического материала «Экспериментальный генетический криобанк»
Магистратура
Факультет осуществляет подготовку: магистров (2 года обучения) по направлению 06.04.01 Биология по образовательной программе "Биология клетки";
При поступлении необходимо сдать экзамен по биологии
Магистерская образовательная программа включает фундаментальные дисциплины по направлению и спецкурсы:
- Физиология клеток иммунной системы
- Клеточный электрогенез
- Стресс и механизмы клеточной адаптации
- Адаптивная регуляция генной экспрессии
- Основы молекулярной биологии клетки
- Внутриклеточная сигнализация
- Молекулярные механизмы сенсорной рецепции
- Кинетика и регуляция внутриклеточных процессов
- Физические методы в молекулярной биофизике
- Структурно-морфологический анализ клеток методом оптической и электронной микроскопии
- Спектральные методы анализа клеток и клеточных популяций
- Клеточная инженерия
- Молекулярные методы клеточной биологии
- Ультразвук в биологии и медицине
- Методы электронной микроскопии в клеточной биологии и медицине
Аспирантура
Факультет осуществляет подготовку: аспирантов (4 года обучения) по направлению 06.06.01 Биологические науки по трем специальностям:
- биофизика – 03.00.02;
- биохимия – 03.00.04;
- молекулярная биология – 03.00.03
При поступлении необходимо сдать экзамены: специальная дисциплина в соответствии с выбранным профилем, иностранный язык.
Факультет осуществляет подготовку аспирантов по 3 направлениям:
Биофизика:
Включает в себя образовательные модули:
- Физика биополимеров и надмолекулярных структур
- Структура и динамика биомолекул: радиоспектроскопия, термодинамика, кинетика
- Биофизика клеточных и мембранных процессов
- Структурные и функциональные особенности поперечно-полосатых и гладких мышц
- Радиационная и экологическая биофизика
Биохимия:
Включает в себя образовательные модули:
- Физико-химические основы биохимии
- Ферментативный катализ
- Молекулярные механизмы биологических процессов, протекающих в клетке
- Методы биохимии
- Хранение и реализация генетической информации
- Молекулярные механизмы сенсорной рецепции
Молекулярная биология:
Включает в себя образовательные модули:
- Структура и биосинтез нуклеиновых кислот. Геномика.
- Структура и функции белков.
- Структура рибосом и биосинтез белка. Белковая инженерия
Преподаватели
Авхачёва Надежда Владимировна, кандидат биологических наук
Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Преподаваемая дисциплина: Стресс и механизмы клеточной адаптации, Клеточный цикл, рост и движение клеток
Научные интересы: Редокс-сигнализация в различных типах клеток
Основные публикации за последние 5 лет:
Список монографий:
Авхачева Н.В. Изменение системы врожденного иммунитета в организме-опухоленосителя.
Использование системного подхода для оценки состояния клеток врожденного иммунитета при развитии опухоли в организме.
LAP LAMBERT Academic Publishing GmbH & Co. KG. 2011. 145 стр. ISBN: 978-3-8433-1380-3.
Глава в монографии Л.В. Ванько, В.Г. Сафронова, Н.К. Матвеева, Г.Т. Сухих.
«Оксидативный стресс в генезе акушерских осложнений».
Глава 1 «Клеточные и молекулярные основы генерации активных форм кислорода».
ООО Издательская группа «ГЭОТАРМедиа», 2010. ISBN 978-5-9704-1717-1
Список статей:
Permyakov, S. E.; Kazakov, A.S.; Avkhacheva, N.V.; Permyakov E.A.
Parvalbumin as a metal-dependent antioxidant. CELL CALCIUM. 2014. 55: 261-268.
Mal’tseva V. N., Avkhacheva N. V., Safronova V. G. Common regularities in changes of the neutrophil functional activity during
in vivo growth of tumors of different immunogenic activity. Bulletin of Experimental Biology and Medicine, Vol. 150, No. 5, March, 2011
Karpukhin A.V., Avkhacheva N.V., Yakovlev R.Yu., Kulakova I.I., Yashin V.A., Lisichkin G.V., Safronova V.G.
Effect of detonation nanodiamonds on phagocyte activity. Cell Biol Int. 2011. 35(7):727-33.
Образование: Пущинский государственный университет, специальность Биология
Стаж работы преподавателем: 8 лет
Премии и награды:
Победы в грантах и научных проектах: гранты РФФИ 14-04-31708 (Р), 16-04-00226 (Р)
Индекс Хирша: 6
Краткая трудовая биография:
Образование:
2010 Повышение квалификации, Преподаватель Высшей школы,
Институт развития дополнительного профессионального образования
2003-2008: r.б.н., Лаборатория клеточной нейробиологии, Институт Биофизики клетки РАН, Россия
2003-2001: Магистр биологии, Пущинский государственный университет, кафедра Биологии клетки/Пущино, Россия
1996-2001: Бакалавр биологии, Воронежский государственный университет,
Биолого-почвенный факультет, кафедра биофизики и биотехнологии/Воронеж, Россия
Стаж работы:
2016-наст. время учёный секретарь
Института биологического приборостроения с опытным производством РАН, Пущино, Россия
2015-2016: помощник учёного секретаря (руководство аспирантурой)
Института биологического приборостроения с опытным производством РАН, Пущино, Россия
2010-2016: старший научный сотрудник, Лаборатория новых методов в биологии,
Институт биологического приборостроения с опытным производством РАН, Пущино, Россия
2003-2010: научный сотрудник, Лаборатория клеточной нейробиологии,
Институт биофизики клетки РАН, Пущино, Россия
2003–2004: стажировка в университете г. Лунда, госпиталь при университете г. Мальмё,
кафедра лабораторной медицины, группа медицинской микробиологии, Мальмё, S-205 02, Швеция
2002-2006: стажировка в лаборатории клинической иммунологии
ФГБУ «Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии им. академика В.И. Кулакова Минздрава России»
2001-2003: старший лаборант-исследователь,
Лаборатория клеточной нейробиологии, Институт биофизики клетки РАН, Пущино, Россия
Асташев Максим Евгеньевич, кандидат биологических наук
Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Преподаваемая дисциплина: Клеточный электрогенез
Научные интересы: ионные каналы и ионотропные рецепторы, цифровая обработка сигналов, системное программирование, автоматизация эксперимента.
Основные публикации за последние 5 лет:
1. Vulfius C.A., Kasheverov I.E., Starkov V.G., Osipov A.V., Andreeva T.V., Filkin S.Yu., Gorbacheva E.V., Astashev M.E., Tsetlin V.I., Utkin Y.N. Inhibition of nicotinic acetylcholine receptors, a novel facet in the pleiotropic activities of snake venom phospholipases A2. PLoS One. 2014, Dec 18; 9(12):e115428. doi: 10.1371/journal.pone.0115428.
2. Aminin D., Pislyagin E., Astashev M., Es’kov A., Kozhemyako V., Avilov S, Zelepuga E., Yurchenko E., Kaluzhskiy L., Kozlovskaya E., IvanovA. & Stonik V. Glycosides from edible sea cucumbers stimulate macrophages via purinergic receptors. Scientific Reports 6, Article number: 39683 (2016). doi:10.1038/srep39683.
3. Belosludtsev K.N., Belosludtseva N.V., Agafonov A.V., Astashev M.E., Kazakov A.S., Saris N.-E.L., Mironova G.D. Ca2+-dependent permeabilization of mitochondria and liposomes by palmitic and oleic acids: A comparative study. Biochimica et Biophysica Acta 2014. V.1838. P. 2600–2606.
4. Astasheva E., Astashev M., Kitchigina V., Changes in the behavior and oscillatory activity in cortical and subcortical brain structures induced by repeated l-glutamate injections to the medial septal area in guinea pigs, Epilepsy Research, 2015; V. 109. P. 134-145.
5. Dubinin M.V., Astashev M.E., Penkov N.V., Gudkov S.V., Dyachenko I.A., Samartsev V.N., Belosludtsev K.N. Effects of phospholipase A2 inhibitors on bilayer lipid membranes. Journal of Membrane Biology, 2016, v.249(3), p.339–347.
6. Astashev M.E., Belosludtsev K.N., Kharakoz D.R., Method for digital measurement of phase-frequency characteristics for a fixed-length ultrasonic spectrometer, Acoustical Physics, 2014; V. 60, I. 3, P. 335–341.
7. Gudkov S.V., Astashev M.E., Bruskov V.I., Kozlov V.A., Zakharov S.D., and Bunkin N.F. Self-oscillating water chemiluminescence modes and reactive oxygen species generation induced by laser irradiation: effect of the exclusion zone created by nafion. Entropy, 2014, V.16(11), P.6166-6185.
Образование:
Ростовский государственный университет (ныне ЮФУ), 2001 год, бакалавриат, физический факультет, физика;
Пущинский государственный университет, 2003 год, магистратура, Биология клетки, Биология,
Основная очная аспирантура РАН, Институт биофизики клетки РАН, 2006 год.
Стаж работы преподавателем: 5 лет
Индекс Хирша: 6
Краткая трудовая биография:
Асташев Максим Евгеньевич – кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории клеточной нейробиологии Института биофизики клетки РАН г. Пущино. В 2001 году окончил физический факультет (направление – физика) Ростовского государственного университета (ныне ЮФУ). В 2001 году приехал в Пущино Московской области, поступил в магистратуру Пущиноского государственного университета и начал научную работу под руководством д.ф.-м.н Казаченко Владимира Николаевича, которая касалась экспериментального исследования внутримолекулярной динамики воротного механизма одиночных К+-каналов. В 2003 году Асташев М.Е. получил диплом с отличием магистра биологии и поступил в основную очную аспирантуру Института биофизики клетки РАН. В 2008 году он защитил диссертацию на соискание степени кандидата биологических наук по теме «Мультифрактальность в активности одиночных К+-каналов» по специальности «Биофизика». За время трудовой деятельности в ИБК РАН Асташев М.Е. участвовал в создании нескольких лабораторных установок: Ультразвукового спектрометра фиксированной длины, Автономного регистратора геофизических характеристик для работы на Северном полюсе Земли, установки пэтч-кламп, флуоресцентной имэджинг-станции для регистрации внутриклеточного кальция, ЭЭГ для работы с подвижными животными, комплекса регистрации физиологических показателей животных (ЭКГ, дыхание, температура тела, показатель микроциркуляции), изолированной камеры для длительной передержки животных в условиях контролируемой атмосферы. Также за время трудовой деятельности в ИБК РАН Асташев М.Е. участвовал в реализации нескольких научных проектов: изучение эффекта долговременной памяти в воротном механизме одиночного ионного канала, изучение молекулярного механизма действия иммуностимуляторов, опосредованного пуриновыми рецепторами, изучение физико-химических свойств липидных слоев и суспензий, изучение микроциркуляторного русла у животных, изучение ритмических процессов в различных биологических и физико-химических системах.
Асташев М.Е. является специалистом в клеточной электрофизиологии, физиологии клеток врожденного иммунитета, цифровой обработке нестационарных сигналов, цифровым системам сбора экспериментальных данных, автоматизации биологического эксперимента, проектировании научного оборудования.
Бережнов Алексей Валерьевич, кандидат биологических наук
Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Преподаваемая дисциплина: Основы молекулярной биологии клеток
Основные публикации за последние 5 лет:
1. Kokoz Y.M., Evdokimovskii E.V., Maltsev A.V., Nenov M.N., Pimenov O.Y., Nakipova O.V., Averin A.S., Teplov I.Y., Berezhnov A.V., Reyes S., Alekseev A.E. Sarcolemmal α2-adrenoceptors control protective cardiomyocyte-delimited sympathoadrenal response. Journal of Molecular and Cellular Cardiology. 2016. Т. 100. С. 9-20.
2. Зинченко В.П., Туровская М.В., Теплов И.Ю., Бережнов А.В., Туровский Е.А. Роль парвальбумин-содержащих интернейронов в регуляции спонтанной синхронной активности нейронов мозга в культуре. Биофизика. 2016. Т. 61. № 1. С. 102-111.
3. Зинченко В.П., Туровский Е.А., Туровская М.В., Бережнов А.В., Сергеев А.И., Дынник В.В. Nad вызывает диссоциацию нейронных сетей на субпопуляции нейронов, подавляя синхронную гиперактивность сетей, индуцированную ионами аммония. Биологические мембраны: Журнал мембранной и клеточной биологии. 2016. Т. 33. № 2. С. 150-158.
4. Safronova V.G., Vulfius C.A., Mal'tseva V.N., Berezhnov A.V., Fedotova E.I., Miftahova R.G., Grinevich A.A., Shelukhina I.V., Kryukova E.V., Tsetlin V.I. Nicotinic receptor involvement in regulation of functions of mouse neutrophils from inflammatory site. Immunobiology. 2016. Т. 221. № 7. С. 761-772.
5. Angelova P.R., Abramov A.Y., Baev A.Y., Berezhnov A.V. Role of inorganic polyphosphate in mammalian cells: from signal transduction and mitochondrial metabolism to cell death. Biochemical Society Transactions. 2016. Т. 44. С. 40-45.
6. Berezhnov A.V., Fedotova E.I., Frolova M.S., Zinchenko V.P., Soutar M.P.M., Plun-Favreau H., Abramov A.Y. Intracellular ph modulates autophagy and mitophagy. Journal of Biological Chemistry. 2016. Т. 291. № 16. С. 8701-8708.
7. Конаков М.В., Бережнов А.В., Теплов И.Ю., Левин С.Г., Годухин О.В. Идентификация и свойства бупивакаин-чувствительных калиевых токов в культивируемых нейронах гиппокампа. Биологические мембраны: Журнал мембранной и клеточной биологии. 2015. Т. 32. № 5-6. С. 363.
8. Konakov M.V., Levin S.G., Godukhin O.V., Berezhnov A.V., Teplov I.Y. Identification and properties of bupivacaine-sensitive potassium currents in cultured hippocampal neurons. Biochemistry (Moscow) Supplement. Series A: Membrane and Cell Biology. 2015. Т. 9. № 4. С. 309-317.
9. Garmash S.A., Smirnova V.S., Karp O.E., Usacheva A.M., Ivanov V.E., Chernikov A.V., Bruskov V.I., Gudkov S.V., Berezhnov A.V. Pro-oxidative, genotoxic and cytotoxic properties of uranyl ions. Journal of Environmental Radioactivity. 2014. Т. 127. С. 163-170.
10. Garmash S.A., Smirnova V.S., Karp O.E., Usacheva A.M., Ivanov V.E., Chernikov A.V., Bruskov V.I., Gudkov S.V., Berezhnov A.V.Corrigendum to "pro-oxidative, genotoxic and cytotoxic properties of uranyl ions" Journal of Environmental Radioactivity. 2014. Т. 129. С. 170. DOI:10.1016/J.JENVRAD.2012.12.009.]
11. Zakharchenko M.V., Zakharchenko A.V., Khunderyakova N.V., Tutukina M.N., Simonova M.A., Vasilieva A.A., Romanova O.I., Fedotcheva N.I., Litvinova E.G., Maevsky E.I., Zinchenko V.P., Berezhnov A.V., Morgunov I.G., Gulayev A.A., Kondrashova M.N. Burst of succinate dehydrogenase and α-ketoglutarate dehydrogenase activity in concert with the expression of genes coding for respiratory chain proteins underlies short-term beneficial physiological stress in mitochondria. The International Journal of Biochemistry & Cell Biology. 2013. Т. 45. № 1. С. 190-200.
12. Бережнов А.В., Кононов А.В., Федотова Е.И., Зинченко В.П. Применение системы анализа изображения для характеристики лигандов ионотропных глутаматных рецепторов в культуре нейронов. Биологические мембраны: Журнал мембранной и клеточной биологии. 2013. Т. 30. № 3. С. 179.
Бобкова Наталья Викторовна, кандидат биологических наук
Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Преподаваемая дисциплина: Нейродегенеративные заболевания
Научные интересы: моделирование нейродегенеративных заболеваний для исследования их патогенеза и разработки средств направленной терапиии
Основные публикации за последние 5 лет:
1. Natalia Bobkova, Irina Guzhova, Boris Margulis, Inna Nesterova, Natalia Medvinskaya, Alexander Samokhin, Irina Alexandrova, David Garbuz, Evgeny Nudler, Michael Evgen’ev. Dynamics of endogenous Hsp70 synthesis in the brain of olfactory bulbectomized mice. Cell Stress Chaperones. 2013; 18(1):109-118
2. N. V. Bobkova, R. A. Poltavtseva, A. N. Samokhin, and G. T. Sukhikh Therapeutic Effect of Mesenchymal Multipotent Stromal Cells on Memory in Animals with Alzheimer-Type Neurodegeneration. Cell Technologies in Biology and Medicine, 2013, No. 2, p.119-121.
3. Bobkova NV, Medvinskaya NI, Kamynina AV, Aleksandrova IY, Nesterova IV, Samokhin AN, Koroev DO, Filatova MP, Nekrasov PV, Abramov AY, Leonov SV, Volpina OM. Immunization with either prion protein fragment 95-123 or the fragment-specific antibodies rescue memory loss and neurodegenerative phenotype of neurons in olfactory bulbectomized mice. Neurobiol Learn Mem. 2014; 107:50-64
4. Bobkova NV, Garbuz DG, Nesterova I, Medvinskaya N, Samokhin A, Alexandrova I, Yashin V, Karpov V, Kukharsky MS, Ninkina NN, Smirnov AA, Nudler E, Evgen'ev M. Therapeutic effect of exogenous hsp70 in mouse models of Alzheimer's disease. J Alzheimers Dis. 2014; 38(2):425-35
5. Панченко М.М., Полтавцева Р.А., Бобкова Н.В., Вельмешев Д.В., Нестерова И.В., Самохин А.Н., Сухих Г.Т. Локализация и характер дифференцировки трансплантированных мезенхимальных мультипотентных стромальных клеток человека в мозге бульбэктомированных мышей. Клеточные технологии в биологии и медицине, 2014, №3, 139-145.
6. А.Н.Кленяева, Р.Н.Чупров-Неточин, Е.И.Марусевич, О.Г.Татарникова, М.А.Орлов, Н.В.Бобкова Получение культуры клеток фибробластов мыши с постоянным уровнем экспрессии белка тау человека и изучение тау зависимой цитотоксичности. Биологические мембраны, 2014, т.31, №3, с.1-10.
7. Н.В.Бобкова, М.Б.Евгеньев. «Изучение динамики нейродегенерации и компенсаторных механизмов у бульбектомированных животных». Глава в Монографии: Нейродегенеративные заболевания: от генома до целостного организма. под ред. акад. М.В. Угрюмова. – М. : Научный мир, 2014. – в 2-х томах – ISBN 4356 , т.2. стр.380-404.
8. Bobkova NV, Evgen'ev M, Garbuz DG, Kulikov AM, Morozov A, Samokhin A, Velmeshev D, Medvinskaya N, Nesterova I, Pollock A, Nudler E. Exogenous Hsp70 delays senescence and improves cognitive function in aging mice. // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (P NATL ACAD SCI USA, Proc Natl Acad Sci USA), 2015. — Vol. 112, — № 52. — P. 16006-16011
9. Bobkova N.V., Lyabin D.N., Medvinskaya N.I., Samokhin A.N., Nekrasov P.V., Nesterova I.V., Aleksandrova I.Y., Tatarnikova O.G., Bobylev A.G., Vikhlyantsev I.M., Kukharsky M.S., Ustyugov A.A., Polyakov D.N., Eliseeva I.A., Kretov D.A., Guryanov S.G., Ovchinnikov L.P. The Y-box Binding Protein 1 Suppresses Alzheimer’s Disease Progression in Two Animal Models // PloS one, 2015. — Vol. 10, — № 9. — P. e0138867
10. Tatarnikova O.G., Orlov M.A., Bobkova N.V. Beta-amyloid and Tau-protein: Structure, Interaction, and Prion-like Properties // BIOCHEMISTRY (MOSCOW). Biokhimiya, 2015. — Vol. 80, — № 13. — P. 1800-1819
11. Bobkova N, Vorobyov V The brain compensatory mechanisms and Alzheimer’s disease progression: a new protective strategy // Neural Regeneration Research, 2015. — Vol. 10, — № 5. — P. 696-697
12. Bobkova N, Vorobyov V, Medvinskaya N, Nesterova I, Tatarnikova O, Nekrasov P, Samokhin A, Deev A, Sengpiel F, Koroev D, Volpina O Immunization against specific fragments of neurotrophin p75 receptor protects forebrain cholinergic neurons in the olfactory bulbectomized mice // Journal of Alzheimer's Disease, 2016. — Vol. 53, — № 1. — P. 289-301
13. Avetisyan AV, Samokhin AN, Alexandrova IY, Zinovkin RA, Simonyan RA, Bobkova NV. Mitochondrial Dysfunction in Neocortex and Hippocampus of Olfactory Bulbectomized Mice, a Model of Alzheimer's Disease. // БИОХИМИЯ, 2016. — Vol. 81, — № 6. — P. 615-623
14. Д.О. Короев, О.М. Вольпина, Т.Д. Волкова, А.В. Камынина, М.П. Филатова, С.М. Баласанянц, А.Н. Самохин, Н.В. Бобкова Синтетический фрагмент 60–70 рецептора конечных продуктов гликозилирования проявляет терапевтическую активность в животной модели болезни Аальцгеймера // Биоорганическая химия, 2017, том 43, № 2, с. 174–179
15. V. Vorobyov, N. Bobkova Intracerebral interplay and neurotransmitter systems involvement in animal models of neurodegenerative disorders: EEG approach expectations // Neural regeneration research 2017,Volume 12,Issue 1: 66-67.
16. Г.Ф. Иваненко, Н.В. Бобкова Состояние глутатиона в плазме крови у животных при развитии экспериментальной патологии, моделирующей нейродегенерацию альцгеймеровского типа // Биофизика 2017 (в печати)
17. Tamara Voronina, Nikolay Grechko, Alla I. Shikhlyarova, Natalia Bobkova Intermittent hypoxic training as an effective method of activation therapy // Cardiometry 2017 issue 10: 93-99 . DOI: 10.12710/cardiometry.2017.9399
Быстрова Марина Федоровна, доктор биологических наук
Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Преподаваемая дисциплина: Учебно-научные семинары
Основные публикации за последние 5 лет:
1. Tarasov M.V., Bystrova M.F., Kotova P.D., Rogachevskaja O.A., Sysoeva V.Y., Kolesnikov S.S. Calcium-gated K+ channels of the KCa1.1- and KCa3.1-type couple intracellular Ca2+ signals to membrane hyperpolarization in mesenchymal stromal cells from the human adipose tissue. // Pflügers Archiv - European Journal of Physiology. - 2017. - V. 469(2). - P. 349–362. – doi: 10.1007/s00424-016-1932-4.
2. Колесникова А.С., Кабанова Н.В., Быстрова М.Ф. Экспрессия генов, кодирующих G-белки семейства GNAT, во вкусовых почках. // Биологические мембраны. - 2017. - Т.34(1). - С. 56-62. - doi: 10.7868/S0233475517010030.
3. Котова П.Д., Тарасов М.В., Быстрова М.Ф. Сигнальные процессы, инициируемые агонистами пуринергических рецепторов в мезенхимных стволовых клетках человека. // Гены и клетки. – 2017. - Т.12(3). - С. 132-133.
4. Черкашин А.П., Рогачевская О.А., Быстрова М.Ф., Колесников С.С. Инвариантность секреции серотонина вкусовыми клетками типа III. Материалы XXIII съезда Физиологического общества им. И. П. Павлова, Воронеж, Россия, 18 - 22 сентября 2017, сборник тезисов, С. 1826 – 1828.
5. Кабанова Н.В., Кучин А.В., Быстрова М.Ф. Экспрессия гастдуцина и трансдуцинов во вкусовых почках. Сборник статей международной конференции «Рецепторы и внутриклеточная сигнализация», Пущино, Россия, 22-25 мая 2017 г, Т.1, С. 383-387.
6. Рогачевская О.А., Черкашин А.П., Котова П.Д., Быстрова М.Ф., Хохлов А.А., Колесников С.С. Клеточный сенсор серотонина. Сборник статей международной конференции «Рецепторы и внутриклеточная сигнализация», Пущино, Россия, 22-25 мая 2017г, Т.1, С.147-151.
7. Тарасов М.В., Котова П.Д., Быстрова М.Ф., Колесников С.С. Пуринергические агонисты гиперполяризуют мезенхимные стромальные клетки, стимулируя кальций-активируемые калиевые каналы KCA1.1- и KCA3.1-типов. Материалы XXIII съезда Физиологического общества им. И. П. Павлова. Воронеж, Россия, 18 - 22 сентября 2017, сборник тезисов, С. 366 – 368.
8. Котова П.Д., Кочкина Е.Н., Ивашин Д.С., Черкашин А.П., Быстрова М.Ф. P2Y рецепторы мезенхимных стромальных клеток человека. Материалы XXIII съезда Физиологического общества им. И. П. Павлова. Воронеж, Россия, 18 - 22 сентября 2017, сборник тезисов, С. 2503 – 2504.
9. Черкашин А.П., Быстрова М.Ф., Рогачевская О.А. Создание клеток, стабильно детектирующих наномолярные концентрации серотонина. 21 Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых «Биология – Наука XXI века». Пущино, Россия, 17-21 апреля 2017, сборник тезисов, С. 79.
Винокуров Максим Григорьевич, доктор биологических наук
Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Преподаваемая дисциплина: 1. Структурно-морфологический анализ клеток методом оптической микроскопии
2. Спектральные методы анализа клетки и клеточных популяций
Научные интересы: Изучение механизмов регуляции апоптоза клеток человека и животных в норме и при патологии
Основные публикации за последние 5 лет:
1. Vinokurov M, Ostrov V, Yurinskaya M, Garbuz D, Murashev A, Antonova O, Evgen'ev M. Recombinant human Hsp70 protects against lipoteichoic acid-induced inflammation manifestations at the cellular and organismal levels. Cell Stress Chaperones. 2012 Jan;17(1):89-101
2. Юринская М.М., Винокуров М.Г., Грачев С.В., Асташкин Е.И. Актовегин снижает апоптоз клеток нейробластомы SK-N-SH, индуцированный пероксидом водорода, в результате ингибирования p38MAPK и PI-3K. Доклады Академии наук, 2014, том 456, № 5, с. 618-621.
3. Юринская М. М., Е. И. Асташкин, С. В. Грачев, М. Г. Винокуров. Актовегин защищает клетки нейробластомы человека SK-N-SH от апоптоза, индуцированного пероксидом водорода, через сигнальные пути PI3K и р38 MAPK. Биологические мембраны, 2015, том 32, № 5–6, с. 455–460. Yurinskaya M, Zatsepina OG, Vinokurov MG, Bobkova NV, Garbuz DG, Morozov AV, Kulikova DA, Mitkevich VA, Makarov AA, Funikov SY, Evgen'ev MB. The fate of exogenous human HSP70 introduced into animal cells by different means. Curr Drug Deliv. 2015;12(5):524-32.
4. Кочеткова О. Ю., М. М. Юринская, М. Б. Евгеньев, Л. И. Шабарчина, А. В. Сусликов, С. А. Тихоненко, М. Г. Винокуров. Влияние инкапсулированного белка теплового шока БТШ70 на основные функциональные свойства фагоцитов крови. Доклады академии наук, 2015, том 465, № 4, с. 506-509.
5. Юринская М. М., В. А. Митькевич, Е. П. Барыкин, Д. Г. Гарбуз, М. Б. Евгеньев, А. А. Макаров, М. Г. Винокуров. Белок теплового шока HSP70 защищает клетки нейробластомы SK-N-SH от нейротоксического действия пероксида водорода и β-амилоидного пептида. Молекулярная биология, 2015, том 49, № 6, с. 1030–1034.
6. Yurinskaya M M , V A Mitkevich, S A Kozin, M B Evgen’ev, A A Makarov, M G Vinokurov. HSP70 protects human neuroblastoma cells from apoptosis and oxidative stress induced by amyloid peptide isoAsp7-Aβ (1-42). Cell Death & Disease. 2015 Nov 19;6:e1977. doi: 10.1038/cddis.2015.336.
7. Кочеткова О. Ю., М. М. Юринская, Л. И. Шабарчина, А. В. Сусликов, А. А. Наумов, С. А. Тихоненко, М. Г. Винокуров. Доставка лактоферрина в клетки с помощью биодеградируемых микрокапсул. Биоорганическая химия, 2016, том 42, № 3, с. 334–338.
8. Юринская М. М., С. Ю. Фуников, М. Б. Евгеньев, М. Г. Винокуров. Экзогенный белок теплового шока HSP70 снижает ответ клеток нейробластомы человека на липополисахариды. Доклады академии наук, 2016, том 469, № 1, с. 111–115.
9. Юринская М.М., Митькевич В.А., Евгеньев М.Б., Макаров А.А., Винокуров М.Г. Белок теплового шока HSP70 снижает индуцированную бета-амилоидными пептидами секрецию TNFα клетками нейробластомы и моноцитами человека. Молекулярная биология, 2016, том 50, № 6, с. 1053–1056.
10. Yurinskaya M.M., Kochetkova O.Yu., Shabarchina L.I., Antonova O.Yu., Suslikov A.V., Evgen’ev M.B., Vinokurov M.G. Encapsulated Hsp70 decreases endotoxin-induced production of ROS and TNFα in human phagocytes. Cell Stress and Chaperones, 2017 Jan;22(1):163-171. doi: 10.1007/s12192-016-0743-z. Epub 2016 Oct 26.
11. Морозов А.В., Юринская М.М., Митькевич В.А., Гарбуз Д.Г., Преображенская О.В., Винокуров М.Г., Евгеньев М.Б., Карпов В.Л., Макаров А.А. Белок теплового шока 70 снижает активность протеасом в клетках нейробластомы человека в присутствии изомеризованного по Asp7 бета-амилоида 1-42. Молекулярная биология, 2017, том 51, № 1, с. 166–171.
Долгачева Людмила Петровна, кандидат биологических наук
Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Преподаваемая дисциплина: Внутриклеточная сигнализация
Научные интересы: внутриклеточная сигнализация, Са2+-сигнализация, диабет II типа, дисфункция митохондрий при болезни Паркинсона.
Основные публикации за последние 5 лет:
1. Turovsky EA, Turovskaya MV, Dolgacheva LP, Zinchenko VP, Dynnik VV (2013) Acetylcholine Promotes Ca2+and NO-Oscillations in Adipocytes Implicating Ca2+→NO→cGMP→cADP-ribose→Ca2+ Positive Feedback Loop - Modulatory Effects of Norepinephrine and Atrial Natriuretic Peptide. PLoS ONE 8(5): e63483. doi:10.1371/journal.pone.0063483
2. Туровский Е.А., Туровская М.В., Толмачева А.В., Долгачева Л.П., Зинченко В.П., Дынник В.В. Пептидные гормоны ANP и CCK, и индуцируют колебания кальция и триггерные переключения в адипоцитах белого жира. Фундаментальные исследования, №8(4), 2013 стр. 905-908
3. Сергеев А.И., Сирота Н.П., Туровский Е.А., Туровская М.В., Хаустова Я.В., Симонова М.А., Гришина Е.В., Долгачева Л.П., Зинченко В.П., Дынник В.В. Дисрегуляция Ca2+ -сигнальных путей адипоцитов при ожирении и диабете 2-го типа, Фундаментальные исследования, №6, 2013 стр. 1436- 1441
4. Туровский Е.А., Туровская М.В., Зинченко В.П., Дынник В.В., Долгачева Л.П. Инсулин через PI3K и PLC индуцирует Са2+-осцилляции в адипоцитах белого жира. Биологические мембраны, 2015, том 32, № 5–6, с. 429–436.
5. Dolgacheva LP, Turovskaya MV, Dynnik VV, Zinchenko VP, Goncharov NV, Davletov B, Turovsky EA. Angiotensin II activates different calcium signaling pathways in adipocytes.Arch Biochem Biophys. 2016 Mar 1;593:38-49. doi: 10.1016/j.abb.2016.02.001. PMID: 26850364
6. Л. П. Долгачева, Е. И. Федотова, А. Ю. Абрамов, А. В. Бережнов. Альфа-синуклеин и дисфункция митохондрий при болезни Паркинсона, Биологические мембраны, 2017, том 34, № 4, с. 4–14
7. Andrey Y. Abramov, Alexey V. Berezhnov, Evgeniya I. Fedotova, Valery P. Zinchenko and Ludmila P. Dolgacheva. Interaction of misfolded proteins and mitochondria in neurodegenerative disorders, Biochemical Society Transactions (2017) DOI: 10.1042/BST20170024
Образование: Харьковский ордена Ленина политехнический институт им. В.И.Ленина, факультет «Автоматики и приборостроения» в 1972 г, специальность по диплому – «Автоматика и телемеханика».
Стаж работы преподавателем: 23 года
Регалии:
Премии и награды:
Победы в грантах и научных проектах: руководитель проекта № 01201258223 Президиума РАН (программа № 7, 2012-2014гг, Изучение механизмов взаимодействия Са2+-сигнальных путей с участием вторичных мессенджеров IP3 и cADPR в адипоцитах при ожирении и диабете 2 типа (2012г-2014).
Индекс Хирша: 7
Участие в редколлегии журналов:
Краткая трудовая биография:
1973 1975: инженер Института биохимии и физиологии микроорганизмов Академии наук СССР, Академгородок в Пущино, Моск. обл.
1975 1985: ст. инженер, Института биологической физики АН СССР, Пущино, Моск. обл.
1986 1991: м.н.с. Института биологической физики АН СССР, Пущино, Моск. обл.
1991 1997: н.с. Института биофизики клетки РАН Пущино, Моск. обл.
1998-2007: с.н.с. Института биофизики клетки РАН Пущино, Моск. обл.
2008- по настоящее время в.н.с. Института биофизики клетки РАН Пущино, Моск. обл.
1995- 2012: доцент кафедры Физиологии клетки, Пущинского государственного университета,
2013- по настоящее время доцент кафедры Биологии клетки Пущинского государственного естественно-научного института Пущино, Моск. обл.
Диссертация на соискание степени кандидата биологических наук: Л.П. Долгачева (1992) "Система электрогенного транспорта ионов кальция в митохондриях и ее функционирование при различных физиологических состояниях"
Участие в подготовке научных кадров: Защита кандидатской диссертации Абжалеловым Бахытбеком Байдосовичем (2003 г, рук. Долгачева), защита магистрской диссертации Конаковым Максимом Викторовичем (2006 г, рук. Долгачева), защита кандидатской диссертации Туровским Егором Александровичем (2012 г, рук. Долгачева).
Зинченко Валерий Петрович, профессор, доктор биологических наук
Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Преподаваемая дисциплина: Внутриклеточная сигнализация, биофизика клетки.
Научные интересы: Рецепция, внутриклеточная сигнализация, биофизика клетки, ионные каналы, синхронная сетевая активность нейронов мозга, нейродегенерация, инсульт, диабет, ГАМКергические нейроны, синхронная активность, внутриклеточная сигнализация, Са2+-связывающие белки, нейродегенерация, гипервозбудимость, гиперсинхронизация, астроциты, эпилепсия, энцефалопатии, ишемия, анализ изображения
Основные публикации за последние 5 лет:
1. Turovsky, E.A., Turovskaya, M.V., Kononov, A.V., & Zinchenko, V.P. (2013). Short-term episodes of hypoxia induce posthypoxic hyperexcitability and selective death of GABAergic hippocampal neurons. Experimental Neurology, 250, 1–7. https://doi.org/10.1016/j.expneurol.2013.09.006
2. Turovsky E.A., Turovskaya M.V., Dolgacheva L.P., Zinchenko V.P., Dynnik V.V. Acetylcholine Promotes Ca2+and NO-Oscillations in Adipocytes Implicating Ca2+→NO→cGMP→cADP-ribose→Ca2+ Positive Feedback Loop - Modulatory Effects of Norepinephrine and Atrial Natriuretic Peptide. 2013, PLoS ONE v.8(5). p. e63483.
3. Marina V. Zakharchenko, A.V. Zakharchenko, N.V. Khunderyakova, M.N. Tutukina, M.A. Simonova, A.A. Vasilieva, O.I. Romanova, N.I. Fedotcheva, E.G. Litvinova, E.I. Maevsky, V.P. Zinchenko, A.V. Berezhnov, I.G. Morgunov, A.A. Gulayeva, M.N. Kondrashova Burst of succinate dehydrogenase and α-ketoglutarate dehydrogenase activity in concert with the expression of genes coding for respiratory chain proteins underlies short-term beneficial physiological stress in mitochondria The International Journal of Biochemistry & Cell Biology, Volume 45, Issue 1, January 2013, Pages 190–200
4. Кононов А.В., Иванов С.В., Зинченко В.П. Селективная регуляция серотониновыми 5НТ1В-рецепторами потенциал-зависимых Са2+-каналов в различных популяциях нейронов гиппокампа. Рос.физиол.журн. им. И.М.Сеченова, 2013, т.99, №1, С 63-72. DOI: 10.1007/s11055-014-0014-3
5. A. V. Berezhnov, A.V. Kononov, E.I. Fedotova, and V.P. Zinchenko Image Analysis Applications for Characterization of Ionotropic Glutamate Receptor Ligands in Cultured Neurons. ISSN 1990_7478, Biochemistry (Moscow)
Supplement Series A: Membrane and Cell Biology, 2013, Vol. 7, No. 3, pp. 213–221. © Pleiades Publishing, Ltd.,
6. Е.А. Turovsky, N.P. Kaimachnikov, V.P. Zinchenko // Agonist specific Participation of SOC and ARC channels and of iPLA 2 in the Regulation of Ca 2+ Entry during Oscillatory Responses in Adipocytes Biochemistry (Moscow) Supplement Series A: Membrane and Cell Biology January 2014, Volume 8, Issue 1, pp 136–143
7. Turovskaya M.V., Turovsky E.A., Kononov A.V., Zinchenko V.P. Short-term hypoxia induces a selective death of GABAergic neurons, 2014, Biochemistry (Moscow) Supplement Series A: Membrane and Cell Biology, V.8, Issue 1, pp 125-135
8. Tukhovskaya, E.A., Turovsky, E.A., Turovskaya, M.V., Levin, S.G., Murashev, A.N., Zinchenko, V.P., & Godukhin, O.V. (2014). Anti-inflammatory cytokine interleukin-10 increases resistance to brain ischemia through modulation of ischemia-induced intracellular Ca2+ response. Neuroscience Letters, 571, 55–60. https://doi.org/10.1016/j.neulet.2014.04.046
9. Denis N. Silachev, Egor Y. Plotnikov, Irina B. Pevzer, Ljubava D. Zorova, Valentina A. Babenko, Savva D. Zorov, Vasily A. Popkov, Stanislovas S. Yankauskas, Valery P. Zinchenko, Gennady T. Sukhikh, and Dmitry B. Zorov Mitochondrion as a key point to regulate ischemic damage. Running Head: Mitochondrion regulate ischemic damage. Heart, Lung and Circulation (2014), Volume 23, Issue 10, October 2014, Pages 897–904
10. Надеев А.Д., Зинченко В.П., Авдонин П.В., Гончаров Н.В. Токсические и сигнальные свойства активных форм кислорода //Токсикологический Вестник. - 2014. - №2 - С. 22-27.
11. Dynnik V.V., Kononov A.V., SergeevA.V., Tankanag A., Zinchenko V.P., To Break or to Brake Neuronal Network Accelerated by Ammonium Ions? 2015, PLoS ONE 10 (7): e0134145.
12. E.A. Turovsky, M.V. Turovskaya, V.P. Zinchenko, V.V. Dynnik, and L.P. Dolgacheva Insulin Induces Ca2+ Oscillations in White Fat Adipocytes via PI3K and PLC ISSN 1990_7478, Biochemistry (Moscow) Supplement Series A: Membrane and Cell Biology, 2016, Vol. 10, No. 1, pp. 53–59.
13. Berezhnov AV, Soutar MP, Fedotova EI, Frolova MS, Plun-Favreau H, Zinchenko VP, Abramov AY. Intracellular pH Modulates Autophagy and Mitophagy. J Biol Chem. 2016 Apr 15; 291(16):8701-8. doi: 10.1074/jbc.M115.691774. Epub 2016 Feb 18. PMID: 26893374
14. Dolgacheva LP, Turovsky EA, Turovskaya MV, Dynnik VV, Zinchenko VP, Goncharov NV, Davletov B. Angiotensin II activate different calcium signaling pathways in adipocytes. Archives of Biochemistry and Biophysics, 2016, 593:38-49 DOI: 10.1016/j.abb.2016.02.001
15. V.P. Zinchenko, M.V. Turovskaya, I.Yu. Teplov, A.V. Berezhnov, and E.A. Turovsky The Role of Parvalbumin-Containing Interneurons in the Regulation of Spontaneous Synchronous Activity of Brain Neurons in Culture ISSN 0006_3509, Biophysics, 2016, Vol. 61, No. 1, pp. 85–93. © Pleiades Publishing, Inc., 2016
16. V.P. Zinchenko, E.A. Turovsky, M.V. Turovskaya, A.V. Berezhnov, A.I. Sergeev, V.V. Dynnik NAD causes dissociation of neural networks into subpopulations of neurons by inhibiting the network synchronous hyperactivity evoked by ammonium ions. Biochemistry (Moscow) Supplement Series A: Membrane and Cell Biology, 2016, 10(2), 118-125 10.1134/S1990747816020124
17. A.D. Nadeev · I.V. Kudryavtsev · M.K. Serebriakova · P.V. Avdonin ·V.P. Zinchenko · N.V. Goncharov Dual proapoptotic and pronecrotic effect of
hydrogen peroxide on human umbilical vein endothelial cells. Cell and Tissue Biology 10(2):145-151 · March 2016 DOI: 10.1134/S1990519X16020097
18. Turovsky, E.A., Turovskaya, M.V., Gaidin, S.G., & Zinchenko, V.P. (2017). Cytokine IL-10, activators of PI3-kinase, agonists of α-2 adrenoreceptor and antioxidants prevent ischemia-induced cell death in rat hippocampal cultures. Archives of Biochemistry and Biophysics, 615, 35–43. https://doi.org/10.1016/j.abb.2017.01.001
19. Зинченко В.П., Гайдин С.Г., Теплов И.Ю, Косенков А,М. Торможение спонтанной синхронной активности нейронов гиппокампа возбуждением ГАМКергических нейронов «Биологические мембраны», 2017, т.34, №4. с. 284–297
20. Maria V. Turovskaya Alexei A. Babaev, Valery P. Zinchenko, Ekaterina A. Epifanova, Ekaterina V. Borisova, Victor S. Tarabykin, Egor A. Turovsky Sip-1 mutation causes a disturbance in activity of NMDA- and AMPA-, but not kainate receptors of neurons in cerebral cortex. Neuroscience Letters v.650April 2017, 180-186. DOI: 10.1016/j.neulet.2017.04.048
21. Andrei Abramov, Alexey Berezhnov, Evgeniya Fedotova, Valery Zinchenko, Ludmila Dolgacheva. Interaction of misfolded proteins and mitochondria in neurodegenerative disorders. 2017 Biochemical Society Transactions DOI: 10.1042/BST20170024
22. Туровский Е.А., Зинченко В.П., Гайдин С.Г., Туровская М.В. Кальций-связывающие белки защищают ГАМКергические нейроны гиппокампа от гибели при гипоксии и ишемии in vitro. «Биологические мембраны», 2017 том 34(5), стр.77-89
Образование:
Окончил радиофизический факультет Нижегородского гос. Университета, по специальности бионика в 1969г
Стаж работы преподавателем: с 1995г
Регалии:
Премии и награды:
Победы в грантах и научных проектах 2013-2017, руководитель грантов:
1. РФФИ, 12-04-01076а, Механизмы модуляции агонистами 5HT1B-рецепторов активности потенциал-зависимых кальциевых каналов в различных популяциях нейронов мозга крысы, 2012- 2014
2. ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» ГК П606, Разработка универсального оптического метода биотестирования лигандов рецепторов, корректирующих психоэмоциональное состояние человека, 2009-2013
3. РФФИ, № 13-04-06024, № 15-04-20314, № 17-04-20114 - гранты на Проведение международной конференции «Рецепторы и внутриклеточная сигнализация 2013, 2015, 2017гг»
4. Президиум РАН, Программа №7, «Механизмы интеграции молекулярных систем при реализации физиологических функций», №01201258222, «Молекулярные механизмы участия серотониновых 5НТ1В рецепторов в регуляции агрессивного поведения», 2012-2014
5. РНФ, № 14-14-00989 «Механизмы регуляции синхронной активности нейронов в мозге различными подтипами ГАМК-ергических нейронов». 2014-2016
6. Минобрнауки (Россия – Германия - Бельгия) № 14.616.21.0039 «Механизмы выживания нейронов при инсульте (NEuroSurv)». 2015-2017.
7. Минобрнауки (Россия – Англия) № 14.616.21.0054, «Изучение механизма нейротоксичности альфа синуклеина при болезни Паркинсона. Роль митохондрий, ионов кальция и окислительного стресса». 2015-2016
Получен патент: Коротеев М.П., Казиев Г.З., Коротеев А.М., Зинченко В.П., Телешев А.Т., Перепелкин М.В. Решение о выдаче патента по Заявке №2013155696/15(086861) «Водорастворимая фармацевтическая композиция L-аргинин – дигидрокверцетин и способ ее получения». ДОМ 22.10.2014, ИЗФ 22.10.2014
Индекс Хирша: 14
Участие в редколлегии журналов: «Биологические мембраны» член президиума экспертного совета «Фонда содействия развитию малых форм предприятий в научно-технической сфере», председатель Оргкомитета девяти международных конференций «Рецепторы и внутриклеточная сигнализация» в 2001-2017 гг,
Редактор сборника «Рецепторы и внутриклеточная сигнализация», Пущино, Fix Print, 2015, 2017, ISBN 978-5-903789-21-4
Краткая трудовая биография:
Зинченко Валеpий Петpович 1945 г.р., русский, после окончания кaфедpы бионики pадиофизического факультета Гоpьковского государственного унивеpситета в 1969 г был рекомендован к поступлению в аспиpантуpу в ИБФ АНСССР. В 1975 г. В.П.Зинченко защитил диссертацию на степень кандидата биологических наук посвященную исследованию энергетики мышечных клеток. В 1991 В.П.Зинченко защитил диссертацию на степень доктора биологических наук по биофизике посвященную исследованию механизма передачи сигнала с пуринорецепторов опухолевых клеток. В 1996 году присвоено звание профессора.
Научные интересы В.П.Зинченко находятся в области исследований механизмов регуляции кальций-зависимых процессов во внутриклеточной сигнализации. Им были исследованы механизмы передачи сигналов в процессах пролиферации и секреции на лимфоцитах, гепатоцитах, кардиомиоцитах, опухолевых клетках, и нейроналных клетках. Им открыто явление импульсной секреции ATP клетками и распространение межклеточного сигнала в виде "АТР - волны". Показана связь внутриклеточной Са2+ волны и направленной импульсной секреции АТР клетками. Открыто 2 новых кальциевых канала плазматической мембраны клеток. За последние 5 лет им опубликовано более 50 статей в отечественных и зарубежных журналах и сборниках. Результаты его работ неоднократно докладывались на международных и российских симпозиумах, конференциях и съездах. За последние 5 лет работы Зинченко В.П. были поддержаны 7 российскими и зарубежными грантами. В настоящее время в лаборатории проводится фундаментальные исследования по установлению новых путей внутриклеточной сигнализации, по поиску новых механизмов управления активностью тормозными ГАМКергическими нейронами, по поиску механизмов
активации эндогенных сигнальных путей защиты клеток от гибели при гиперактивации, ишемии и при различных нейродегенеративных заболеваниях. Исследуются механизмы перехода в различные режимы синхронной активности нейронов мозга. Исследуются новые механизмы регуляции митофагии и автофагии. Взаимодействие сигнальных путей в процессах адаптации к гипервозбуждению и ишемии, ведется поиск новых физиологически-активных соединений, имитирующих действие противовоспалительных цитокинов.
Зинченко В.П. читает курс лекций по внутриклеточной сигнализации в ПущГЕНИ и курс лекций «Биофизика клеточных процессов» для аспирантов РАН. Под руководством Зинченко В.П. выполнено 13 диссертационных работ.
Зинченко В.П. обладает большой научной эрудицией и высокой квалификацией экспериментатора. Владеет многими биофизическими, биохимическими и цитологическими методами.
Каймачников Николай Петрович, кандидат биологических наук
Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Преподаваемая дисциплина: Кинетика и регуляция внутриклеточных процессов
Основные публикации за последние 5 лет:
Туровский Е.А., Зинченко В.П., Каймачников Н.П. Пуринергическая составляющая кальциевых сигналов в адипоцитах. В сборнике: Рецепторы и внутриклеточная сигнализация Сборник статей. Под редакцией В.П. Зинченко, А.В. Бережнова. Пущино, 2015. С. 204-210.
Turovsky E.A., Kaimachnikov N.P., Zinchenko V.P. Agonist-specific participation of soc and arc channels and ipla2 in the regulation of ca2+ entry during oscillatory responses in adipocytes. Biochemistry (Moscow) Supplement. Series A: Membrane and Cell Biology. 2014. Т. 8. № 1. С. 136-143.
Мальцева Валентина Николаевна, кандидат биологических наук
Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Преподаваемая дисциплина: Физиология клеток иммунной системы
Научные интересы: Изучение функциональной активности и внутриклеточной сигнализации клеток иммунной и нервной системы, их модификации при патологических процессах, иммунология, онкоиммунология, биофизика, внутриклеточная сигнализация
Основные публикации за последние 5 лет:
Safronova V.G., Vulfius C.A., Shelukhina I.V., Mal'tseva V.N., Berezhnov A.V., Fedotova E.I., Miftahova R.G., Kryukova E.V., Grinevich A.A., Tsetlin V.I. Nicotinic receptor involvement in regulation of functions of mouse neutrophils frominflammatory site. Immunobiology. 2016. V. 221. No 7. P. 761-772.
Образование (что окончил, когда, направление/специальность):
1997-2002 Удмуртский государственный университет, факультет Медицинская биотехнология, биохимик
2002-2004 Пущинский государственный университет, факультет Биология клетки, магистратура
2004-2007 Институт биофизики клетки, аспирантура, 2007 году защитила диссертацию по специальности 03.00.02 «биофизика»
Стаж работы преподавателем:
2008-2017, 9 лет
Премии и награды:
лауреатом Благотворительного Фонда содействия отечественной науке по программе "Лучший аспирант РАН"
Победы в грантах и научных проектах:
- гранты РФФИ, НШ, грант Шведского Института (Swedish Institute, grant Dr. A. Bredberg, Lund University, Sweden
- Travel Young Grant EMBO / FEBS для участия в Специализированной FEBS Конференции (Бельгия, Брюссель)
- Travel Young Grant EMBO / FEBS для участия в школе-конференции "Молекулярные механизмы в передаче сигнала и рак» (Греция)
Индекс Хирша: 6
Краткая трудовая биография:
Опыт работы с 2001 года, совмещала учебу в Удмуртском государственном университете с работой лаборанта на кафедре иммунологии.
С 2002 года работала в лаборатории клеточной нейробиологии Института биофизики клетки РАН сначала в должности лаборанта, затем научного сотрудника. Участвовала в работе Летней школы для американских студентов (Пущинский Научный Центр, 2003-2009), обучая участников школы основам иммунологии и методам экспериментальной биологии. В 2008-2009 г.г. принимала участие в качестве руководителя и эксперта секции "Физиология животных и биомедицина" Международной Пущинской школы-конференции молодых ученых «БИОЛОГИЯ – НАУКА XXI ВЕКА».
В 2009 году перешла на работу в институт Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАН в лабораторию клеточной инженерии в должности научного сотрудника.
С 2008 года по настоящее время являюсь доцентом учебного центра «Биология клетки» Пущинского государственного естественно-научного института. Разработала и преподаю специальный курс «Физиология клеток иммунной системы» для магистрантов.
Масулис Ирина Станиславовна, кандидат биологических наук
Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Преподаваемая дисциплина: Адаптивная регуляция генной экспрессии
Основные публикации за последние 5 лет:
1. Маркелова Н.Ю., Масулис И.С., Озолинь О.Н. Rep-элементы генома escherichia coli и сигналы транскрипции: позиционный и функциональный анализ. Математическая биология и биоинформатика. 2016. Т. 11. № S. С. t1-t14.
2. Маркелова Н.Ю., Масулис И.С., Озолинь О.Н. Rep-элементы генома escherichia coli и сигналы транскрипции: позиционный и функциональный анализ. Математическая биология и биоинформатика. 2015. Т. 10. № 1. С. 245-259.
3. Сухаричева Н.А., Киселев С.С., Озолинь О.Н., Масулис И.С. Вариабельность транскрипционного ландшафта межгенной области oppa- oppb у бактерий по данным компьютерного предсказания потенциальных стартов синтеза РНК. Математическая биология и биоинформатика. 2015. Т. 10. № 2. С. 294-308.
4. Masulis I.S., Babaeva Z.S., Ozoline O.N., Chernyshov S.V. Visualizing the activity of escherichia coli divergent promoters and probing their dependence on superhelical density using dual-colour fluorescent reporter vector. Scientific Reports. 2015. Т. 5. С. 11449.
5. Панюков В.В., Киселев С.С., Шавкунов К.С., Масулис И.С., Озолинь О.Н. Мультиспецифичные промоторные островки как участки генома с необычными структурными и функциональными свойствами. Математическая биология и биоинформатика. 2013. Т. 8. № 2. С. 432-448.
6. Panyukov V.V., Kiselev S.S., Shavkunov K.S., Masulis I.S., Ozoline O.N. Mixed promoter islands as genomic regions with specific structural and functional properties. Mathematical Biology and Bioinformatics. 2013. Т. 8. С. t12.
Никитин Владимир Афанасьевич, кандидат биологических наук
Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Преподаваемая дисциплина: Клеточная инженерия
Основные публикации за последние 5 лет:
1. Никитин В.А., Фесенко Е.Е. Проблемы микрохирургии единичной клетки и возможные пути их решения. Биофизика. 2016. Т. 61. № 3. С. 537-546.
2. Nikitin V.A. Microtools for microsurgery and reconstruction of a single cell (in a field of cell engineering). // Lambert Academic Publishing. – 2017. – 136 стр.
Новоселов Владимир Иванович, доктор биологических наук, профессор
Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Преподаваемая дисциплина: Молекулярные механизмы сенсорной рецепции
Научные интересы: защитные системы организма, антиоксидантные системы, создание лекарственных препаратов нового поколения.
Основные публикации за последние 5 лет:
1. Варламова Е.Г. Новоселов В.И. Поиск партнеров нового селенового белка млекопитающих (SelV)
и экспрессия его мРНК в процессе онтогенеза и сперматогенеза. Молекулярная биология, 2012, 46(2), 276-284
2. Новоселов В.И. Роль пероксиредоксинов при окислительном стрессе в органах дыхания.
Обзор. Пульмонология, 2012, Том 10 (1), стр. 80-88
3. Novoselov V.I. Sharapov M, Volkova A., Mubarakshina E., Antioxidant systems in rat trachea
upon thermal and chemical burns of upper airway. Eur. Respir. J., 2013, Volume 42, р.85S.
4. Варламова Е.Г., Гольтяев М.В., Новоселов С.В., Новоселов В.И., Фесенко Е.Е.
Характеристика некоторых представителей суперсемейства тиоловых оксиредуктаз Молекулярная биология, 2013, т. 47, №4, 568-582.
5. Варламова Е.Г., Гольтяев М.В., Новоселов С.В., Новоселов В.И., Фесенко Е.Е.
Биосинтез и механизм встраивания селенцистеина в синтезируемые белки. Молекулярная биология, 2013, 47(4), 558-567
6. Волкова А.Г., Шарапов М.Г., Равин В.К., Гордеева А.Е. , Карадулева Е.A., Мубаракшина Э.К., Темнов А.А.,
Фесенко Е.Е., Новоселов В.И. Эффект различных ферментов-антиоксидантов на регенеративные процессы
в эпителии трахеи после химического ожога. Пульмонология, 2014, 12 (2), 84-90
7. Шарапов М.Г., Равин В.К., Новоселов В.И. Пероксиредоксины – многофункциональные ферменты.
2014. Молекулярная биология, 48, 4, 600-628
8. Gordeeva A.E., Sharapov M.G., Temnov A.A, Novoselov V.I. The effects of Peroxiredoxin VI on the preservation
of the small intestine in rats after ischemia/reperfusion damage. News of Science and Education. 2014, 12(12), 44-51.
9. Гордеева А.Е., Шарапов М.Г., Новоселов В.И., Фесенко Е.Е., Темнов А.А., Хубутия М.Ш.
Влияние пероксиредоксина VI на сохранение тонкой кишки при ишемии/реперфузии. 2014. Трансплантология, 8, №4, стр. 21-27.
10. Гольтяев М.В., Е. Г. Варламова, В. И. Новосёлов, Е. Е. Фесенко. Определение уровня экспрессии мРНК
генов mgpx6 и mselv в процессе постнатального развития мышы. 2014 г. Докл. Акад. наук, 2014, 457(2), 239-240
11. Grigoriev P.A., Sharapov M.G., Novoselov V.I. Properties of ion channels formed by peroxiredoxin-6 in the lipid bilayers:
cluster channel inactivation. J.Bio.Phys.Chem. 2014, v.14, pp.1- 3, Doi:10.5402/2012/204104
12. Хубутия М.Ш., Вагабов А.В., Темнов А.А., Абрамов В.Ю., Новоселов В.И., Склифас А.Н., Кукушкин Н.И.
Применение мезенхимальных стволовых клеток способствует уменьшению степени ишемически-реперфузионного
поражения различных органов в эксперименте: акцент на паракринные механизмы. Нефрология и диализ. 2014, 16(4), 418-424.
13. Гордеева А.Е.1, Кочкина А.В., Карадулева Е.В., Новоселов В.И. Распределение экзогенных ферментов-антиоксидантов
в организме при свободно-радикальных патологияхю. Международный научно-исследовательский журнал 2015, 40(3), 6-10
14. Варламова Е.Г., Новоселов С.В., Новоселов В.И. cDNA клонирование, экспрессия и определение субстратной специфичности
мышинового селен-содержащего белка SelV (Selenoprotein V)]. Молекулярная биология 2015, 49(5), 785-789.
15. Григорьев П.А., Шарапов М.Г., Новоселов В.И. Потенциал-зависимая катионная селективность ионных каналов,
образованных пероксиредоксином 6 в липидном бислое. Биофизика, 2015, 60(4):696-699.
16. Палутина О.А., Шарапов М.Г., Темнов А.А., Новоселов В.И. Нефропротективный эффект экзогенных ферментов-антиоксидантов
при ишемически-реперфузионном повреждении тканей почки. Бюлл.эксп.биол.мед. 2015, 160(9), 305-310.
17. Gordeeva A.E., Temnov A.A., Charnagalov A.A., Sharapov M.G., Fesenko E.E., Novoselov V.I. Protective effect of peroxiredoxin 6
in ischemia/reperfusion-induced damage of the small intestine. Dig.Dis.Sci., 2015, vol. 60, № 12, pp.3610-3619.
18. Е.В.Карадулева, Э.К.Мубаракшина, М.Г.Шарапов, А.Е.Волкова, О.Ю.Пименов, В.К.Равин, Ю.М.Кокоз, В.И.Новоселов.
Кардиопротекторный эффект модифицированных пероксиредоксинов при ретроградной перфузии изолированного сердца крысы
в условиях окислительного стресса. Бюлл.эксп.биол.мед. 2015, 160(11), 584-588.
19. Терещенко А.В., Темнов А.А., Кодунов А.М., Нечеснюк С.Ю., Склифас А.Н., Новоселов В.И., Демьянченко С.К.
Лечение термического ожога роговицы препаратом пептидов в эксперименте.
Катарактальная и рефракционная хирургия. 2015, 15(4), 44-50.
20. Шарапов М.Г., Новоселов В.И., Равин В.К. Получение химерного, совмещеющего активности супероксиддисмутазы и пероксида.
Биохимия, 2016, 81(4), 571-579.
21. Шарапов М.Г., Гудков С.В., Гордеева А.Е., Карп О.Э., Иванов В.Е., Шелковская О.В., Брусков В.И., Новоселов В.И., Фесенко Е.Е.
Пероксиредоксин 6 – природный радиопротектор. ДАН, 2016, 467(3), 355-358.
22. A.A. Temnov, A.V. Vagabov, A.N. Sklifas, V.I. Novoselov, and Y.A. Belyi. The role of mesenchymal stromal cells in the repair of acute organ injury.
In: The Biology and Therapeutic Application of Mesenchymal Cells – Set. (Kerry Atkinson, Editor). 2017, pp.496-523,
Wiley-Blackwell, USA. ISBN: 978-1-118-90751-1
23. Gordeeva A., Sharapov M., Tikhonova I., Chemeris N., Fesenko E., Novoselov V., Temnov A. Vascular pathology in ischemia/reperfusion-induced
damage of small intestine of rat. Cell Tissues Organs. 2017, 203 (6):353-364.
24. Кочкина А.В., Рогов К.А., Шарапов М.Г., Евдокимов В.А., Музафаров Е.Н., Новоселов В.И., Мелерзанов А.В., Темнов А.А.
Влияние пероксиредоксинов и паракринных факторов мезенхимальных стволовых клеток на заживление полнослойной кожанной раны.
Клиническая и экспериментальная морфология. 2017, 2(22), 52-58.
Образование:
Ростовский государственный университет, 1969 г., физический факультет
Стаж работы преподавателем: Профессор ПущГЕНИ с 1995г.
Премии и награды:
Медаль - 850 лет Москве
Орден Губернатора Московской области - «Научная династия»
Грамота Президиума РАН
Победы в грантах и научных проектах:
1. ФЦП «Научные и научно-технические кадры инновационной России» «Разработка адресной доставки лекарственных препаратов мощного антиоксидантного действия на основе пероксиредоксинов для терапии ишемии и инфаркта миокарда». ГК. № 02.740.11.0387
2. ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям
развития научно-технического комплекса России на 2007-2013 годы» "Разработка способов получения высокоэффективных продуцентов ферментов, синергически сочетающих пероксидазную и супероксиддисмутазную активности, для создания нового класса лекарственных препаратов для лечения заболеваний, сопровождающихся окислительным стрессом". ГК № 16.512.11.2169
3. Программа Президиума РАН "Молекулярная и клеточная биология", Фундаментальная социально ориентированная тематика. «Исследование влияния модифицированных рекомбинантных форм пероксиредоксина 6 и различных способов его доставки на эффективность лечения воспалительных процессов различной этиологии с целью создания новых лекарственных препаратов». Регистрационный номер НИОКР 01200962096.
4. Программа Секции прикладных исследований при Президиуме РАН. «Исследование по оценке природных антиоксидантных систем покровных тканей для разработки противоожоговых средств защиты органов дыхания и кожи», шифр «Аравана», договор № 1437 от 18.03.2005 г.
5. Программа Президиума РАН "Молекулярная и клеточная биология", Фундаментальная социально ориентированная тематика. «Создание новых типов антивоспалительных лекарственных препаратов эндотелий-протекторного и иммуномодулирующего действия на основе модифицированных ферментов-антиоксидантов и тимусных пептидов». Регистрационный номер НИОКР: 01201359149
6. РФФИ 96-04-48161-а. Молекулярные механизмы функционирования обонятельных рецепторов позвоночных, (1996-1998)
7. РФФИ 99-04-48170-а. Молекулярные механизмы функционирования обонятельного анализатора позвоночных, (1999-2000)
8. РФФИ 01-04-48183-а. Молекулярные механизмы функционирования обонятельного анализатора млекопитающих, (2001-2003)
9. РФФИ 04-04-48397-а. Молекулярные механизмы функционирования защитных систем эпителиальных тканей, (2004-2006)
10. РФФИ 08-04-00707-а. Идентификация белков, взаимодействующих с секреторными белками обонятельного и респираторного эпителиев, (2008-2010)
11. РФФИ 13-04-00537. Исследование эндотелий-протекторных эффектов химерных ферментов с совмещенными пероксидазной и супероксиддисмутазной активностями на изолированных органах. (2013-2015)
12. РФФИ 17-04-00356. Исследование молекулярных механизмов нефропротекторного действия экзогенных пероксиредоксинов и их модифицированных форм на модели острой почечной недостаточности у мыши.
Индекс Хирша:
13 (WEB of Science), 10 (РИНЦ)
Участие в редколлегии журналов:
Член коллегии ВАК (биологические науки)
Эксперт Президиума РАН
Краткая трудовая биография:
1969-1990 гг.
Стажер-исследователь, старший лаборант, инженер, младший научный сотрудник, старший научный сотрудник Института биофизики клетки АН СССР
1991 г. - по настоящее время
Ведущий научный сотрудник, главный научный сотрудник Института биофизики клетки РАН
Озолинь Ольга Николаевна, профессор, доктор биологических наук
Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Преподаваемая дисциплина: Адаптивная регуляция генной экспрессии
Научные интересы: бактериальный трпанскриптом, РНК-секретом, межклеточные контакты в сложных сообществах микроорганизмов.
Основные публикации за последние 5 лет:
1. V.V. Panyukov, O.N. Ozoline Promoters of Escherichia coli versus Promoter islands: function and structure comparison. PLoS ONE, 2013, V. 8(5), e62601. DOI: 10.1371/journal.pone.0062601.
2. V.V. Panyukov, S.S. Kiselev, K.S. Shavkunov, I.S. Masulis, O.N. Ozoline Mixed promoter islands as genomic regions with specific structural and functional properties. Mathematical biology and Bioinformatics 2013, 8(2) t12-t26. OI: 10.17537/2013.8.432.
3. Yu.A. Purtov, O.A. Glazunova , S.S. Antipov, V.O. Pokusaeva, E.E. Fesenko, V.V. Preobrazhenskaya, K.S. Shavkunov, M.N. Tutukina, V.I. Lukyanov, O.N. Ozoline Promoter islands as a platform for interaction with nucleoid proteins and transcription factors. J. Bioinformatics and computational biology, 2014, V.12(2) ID 1441006. DOI: http://dx.doi.org/10.1142.
4. I.S. Masulis, Z.S. Babaeva, O.N. Ozoline, S.V. Chernyshov 2015 Visualizing the activity of Eschecrichia coli divergent promoters and probing their dependence on superhelical density using dual-colour fluorescent reporter vector. Scientific Reports V. 5. P. 11449. DOI: 10.1038/srep11449.
5. V.V. Melekhov, U.S. Shvyreva, A.A. Timchenko, M.N. Tutukina, E.V. Preobrazhenskaya, D.V. Burkova V.G. Artiukhov, O.N. Ozoline, S.S. Antipov 2015 Modes of Escherichia coli Dps Interaction with DNA as Revealed by Atomic Force Microscopy. PLOS ONE, V. 10(5), e0126504. DOI: 10.1371/journal.pone.0126504. 6. O.A. Glazunova, S.S. Kiselev, K.S. Shavkunov, A.A. Bykov, V.V. Panyukov, O.N. Ozoline 2015 Promoter islands in the genome of E. Coli: cjmparative analysis against AT-rich sequences. Mathematical biology and Bioinformatics, . Т. 10. № S. С. t29-t38. DOI: 10.17537/2015.10.t29. 7. N.Yu. Markelovaa, I.S. Masulisa, O.N. Ozoline 2015 Rep-elements of the Escherichia coli genome and transcription signals: positional and functional analysis. Mathematical Biology and Bioinformatics, V. 10 (1), 245–259. DOI: 10.17537/2015.10.245. 8. M.N. Tutukina, A.V. Potapova, J. Cole, O.N. Ozoline 2016 Control of hexuronate metabolism in Escherichia coli by the two interdependent regulators, ExuR and UxuR: derepression by heterodimer formation. Microbiology-SGM, V. 162, 1220-1231. DOI:10.1099/mic.0.000297. 9. M.N. Tutukina, A.V. Potapova, P.K. Vlasov, Y.A. Purtov, O.N.Ozoline 2016 Structural modeling of the ExuR and UxuR transcription factors of E-coli: search for the ligands affecting their regulatory properties. J Biomol Struct & Dyn V. 34(10), 2296-2304 DOI: 10.1080/07391102.2015.1115779. 10. K. Neuhaus, R. Landstorfer, L. Fellner, S. Simon, A. Schafferhans, T. Goldberg, H. Marx, O.N. Ozoline, B. Rost, B. Kuster, D.A. Keim, S. Scherer, 2016 Translatomics combined with transcriptomics and proteomics reveals novel functional, recently evolved orphan genes in Escherichia coli O157:H7 (EHEC). BMC Genomics, V. 17, 133. DOI: 10.1186/s12864-016-2456-1. 11.S.S. Kiselev, O.N. Ozoline, O.A. Glazunova, V.V. Panyukov, K.S. Shavkunov, 2017 Novel elements of bacterial genomes – promoter islands: intraspecies polymorphism and sequence stability. Current Bioinformatics, V. 12, 194-201. DOI: 10.2174/1574893612666170321144558. 12. S.S. Antipov, M.N. Tutukina1, E.V. Preobrazhenskaya, F.A. Kondrashov, M.V. Patrushev, S.V. Toshchakov, I. Dominova, U.S. Shvyreva, V.V. Vrublevskaya, O.S. Morenkov, N.A. Sukharicheva, V.V. Panyukov, O.N. Ozoline, 2017 The nucleoid protein Dps binds genomic DNA of Escherichia coli in a non-random manner. PLoS One, V. 12(8), e0182800. DOI: 10.1371/journal.pone.0182800. 13. S. Antipov, S. Turishchev, Y. Purtov, U. Shvyreva, A. Sinelnikov, Y. Semov, E. Preobrazhenskaya, A. Berezhnoy, N. Shusharina, N. Novolokina, V. Vakhtel, V. Artyukhov, O. Ozoline, 2017 The oligomeric form of the Escherichia coli Dps protein depends on the availability of iron ions. Molecules, V. 22, 1904. DOI: 10.3390/molecules22111904. 14. V.V. Panyukov, S.S. Kiselev, O.V. Alikina, N.N. Nazipova, O.N. Ozoline, 2017 Short unique sequences in bacterial genomes as strain- and species-specific signatures. Mathematical Biology and Bioinformatics, V. 12(2), 547-558. DOI: 10.17537/2017.12.547.
Образование (что окончил, когда, направление/специальность): Физический факультет Казанского государственного университета им. В.И. Ленина, 1974 г.
Стаж работы преподавателем: 4 года
Премии и награды:
- 1997 – Правительственная медаль за выдающиеся достижения в области научных исследований (Регистрационный номер NA/0776225)
- 4 Февраля 2011 - Почётный знак "Благодарю" от губернатора Московской области
- 8 февраля 2016 – Благодарность губернатора Московской области как руководителю научного коллектива.
Победы в грантах и научных проектах за последние 5 лет:
РФФИ:
- № 10-04-01218-а «Структурно-функциональный анализ новых элементов бактериального генома» (2010-2012).
- № 13-04-00997 «"Промоторные островки" бактериальных геномов как инструмент эволюционной адаптации чужеродного генетического материала» (2013-2015).
- № 16-04-01570 «"Промоторные островки" как продукт адаптивной эволюции бактериальных геномов (2016-2018)
Министерство образования и науки РФ:
- Проект №01201276858 «Множественные промоторы как индикаторы перекрывающейся транскрипции и альтернативного кодирования», выполненный в соответствии с Гос. Заданием Министерства образования и науки РФ (2012-2013).
Российский научный фонд
- Проект №141400985 "Обогащённые промоторами участки бактериальных геномов как возможные продуценты сигнальных и регуляторных олигонуклеотидов" (2014-2016)
Индекс Хирша: 12
Участие в редколлегии журналов:
FEMS Microbiology Letters,
Applied Cell Biology,
American Journal of Bacteriology,
American Journal of Experimental Biology.
Основные достижения:
- Создан алгоритм поиска бактериальных промоторов (http://www.mathcell.ru/model6.php?l=en)
- В бактериальных геномах обнаружены участки, аномально обогащённые промотор-подобными сайтами (промоторные островки), и установлено их структурное, функциональное и эпигенетическое отличие от обычных промоторов. Оно включает: повышенный уровень суперскрученности, предпочтительный синтез коротких РНК и пониженный уровень модификаций азотистых оснований.
- Охарактеризована популяция коротких РНК (11-14 н.), секретируемых клетками кишечной палочки и нового изолята рода Parnibacillus в разных условиях роста. Обнаружены отличия в РНК-секретомах бактерий, культивируемых индивидуально и в условиях смешанного роста, что свидетельствует об участии коротких РНК в межклеточных коммуникациях.
- Предложен новый подход для типирования микроорганизмов в сложных смесях, способный одновременно идентифицировать их видовую и штаммовую принадлежность.
- Обнаружено повышенное сродство структурного белка бактериального нуклеоида Dps к разветвлённым структурам в ДНК и РНК, а также доказано его неслучайное распределение по геному во время экспоненциального роста.
- Обнаружены лиганды, способные изменять олигомерную форму Dps и влиять на характер его взаимодействия с ДНК.
Рогачевская Ольга Анатольевна, кандидат биологических наук
Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Преподаваемая дисциплина: Учебно-научные семинары
Научные интересы: рецепция, вкусовая сенсорная система, внутриклеточная сигнализация, культура клеток, экспрессия генов
Основные публикации за последние 5 лет:
1. Romanov R.A., Bystrova M.F., Rogachevskaja O.A., V.B. Sadovnikov, V.I. Shestopalov, Kolesnikov S.S. Dispensable ATP permeability of Pannexin 1 channels in a heterologous system and in mammalian taste cells. // J. Cell Sci. 2012. 125. Р.5514-23.
2. Andreev Y.A., Kozlov S.A., Korolkova Y.V., Dyachenko I.A., Bondarenko D.A., Skobtsov D.I., Murashev A.N., Kotova P.D., Rogachevskaja O.A., Kabanova N.V., Kolesnikov S.S., Grishin E.V. Polypeptide modulators of TRPV1 produce analgesia without hyperthermia. // Marine Drugs. 2013, 11(12):5100-15. doi: 10.3390/md11125100.
3. Kotova P.D., Sysoeva V.Y., Rogachevskaja O.A., Bystrova M.F., Kolesnikova A.S., Tyurin-Kuzmin P.A., Fadeeva J.I., Tkachuk V.A., Kolesnikov S.S. Functional expression of adrenoreceptors in mesenchymal stromal cells derived from the human adipose tissue. // BBA, 2014. 1843, 1899-1908.
4. Cherkashin A.P., Kolesnikova A.S., Tarasov M.V., Romanov R.A., Rogachevskaja O.A., Bystrova M.F., Kolesnikov S.S. Expression of calcium-activated chloride channels Ano1 and Ano2 in mouse taste cells. // Pflugers Arch. 2016. 468(2):305-19. DOI 10.1007/s00424-015-1751-z
5. Tarasov M.V., Bystrova M.F., Kotova P.D., Rogachevskaja O.A., Sysoeva V.Y., Kolesnikov S.S. Calcium-gated K+ channels of the KCa1.1- and KCa3.1-type couple intracellular Ca2+ signals to membrane hyperpolarization in mesenchymal stromal cells from the human adipose tissue. // Pflügers Archiv - European Journal of Physiology. 2017. 469(2):349–362.
Образование:
Нижегородский государственный университет имени Н.И. Лобачевского, 1997г., бакалавр биологии;
Пущинский государственный университет, 1999г., магистр биологии;
Стаж работы преподавателем: 1,5 года
Премии и награды: победитель конкурса работ молодых ученых г. Пущино, 2008-2010гг; призер конкурса научных работ Института биофизики клетки РАН, 2009-2014гг;
Победы в грантах и научных проектах: грант Президента РФ для поддержки молодых ученых – кандидатов наук; ФЦП «Научные и педагогические кадры инновационной России», ГК № П809; соглашение №8782, Министерство образования и науки Российской Федерации; РФФИ 14-04-01711 и 17-04-01941
Индекс Хирша: 8
Краткая трудовая биография:
1994-1997 г. Нижний Новгород, Нижегородская медицинская академия, лаборант лаборатории электронной микроскопии ЦНИЛ;
1997-по настоящее время - г. Пущино, М/О, Институт биофизики клетки РАН, последовательно магистрант (лаборант-исследователь), аспирант научной группы «Клетка», затем младший научный сотрудник, старший научный сотрудник, ведущий научный сотрудник в лаборатории «Молекулярная физиология клетки».
Семисотнов Геннадий Васильевич, профессор, доктор физико-математических наук
Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Преподаваемая дисциплина: Физические методы в молекулярной биофизике
Научные интересы: структура, стабильность и самоорганизация белков, молекулярные шапероны, белок-белковые взаимодействия, оптическая спектроскопия
Основные публикации за последние 5 лет:
1. Guryanov S.G, Filimonov V.V., Timchenko A.A., Melnik B.S., Kihara H., Kutyshenko V.P., Ovchinnikov L.P., Semisotnov G.V. The major mRNP protein YB-1: structural and association properties in solution. Biochim Biophys Acta. 2013; 1834(2):559-67.
2. Рябова Н.А., Марченков В.В., Марченкова С.Ю., Котова Н.В., Семисотнов Г.В. Молекулярный шаперон GroEL/ES: процессы денатурации и ренатурации. Усп Биол Хим. 2013; 53:59-80.
3. Ryabova N., Marchenkov V., Kotova N., Semisotnov G. Chaperonin GroEL reassembly: an effect of protein ligands and solvent composition. Biomolecules. 2014; 4(2):458-73.
4. Marchenko N.Y., Marchenkov V.V., Semisotnov G.V., Finkelstein A.V. Strict experimental evidence that apo-chaperonin GroEL does not accelerate protein folding, although it does accelerate one of its steps. Proc Natl Acad Sci U S A. 2015; 112(50):E6831-2.
5. Marchenko N.Y., Sikorskaya E.V., Marchenkov V.V., Kashparov I.A., Semisotnov G.V. Affinity chromatography of chaperones based on denatured proteins: Analysis of cell lysates of different origin. Protein Expr Purif. 2016; 119:117-23.
Образование:
Ленинградский государственный университет, 1975, физик/биофизик.
Аспирантура в Институте белка РАН, защита кандидатской диссертации физ.-мат. наук, 1982.
Защита докторской диссертации физ.-мат. наук, 1995.
Стаж работы преподавателем: 5 лет
Победы в грантах и научных проектах:
Активно участвовал в качестве ответственного исполнителя ряда престижных международных проектов, финансируемых фондами HFPS (1992-1994), HHMI (1995-2005). Неоднократно являлся руководителем проектов РФФИ (1994-1996, 1997-1999, 2000-2002, 2003-2005, 2004-2006, 2009-2011) и ответственным исполнителем РНФ (2014-2016, 2017-2018), МКБ (2013-2017), Госконтракта с Минобрнауки (2009-2011).
Индекс Хирша: 16
Участие в редколлегии журналов: В качестве приглашенного рецензента постоянно участвует в рецензиях научных публикаций как в иностранных (Biochemistry, Biochemia, European Biophysical Journal, FEBS Letters), так и в отечественных (Биохимия, Биофизика, Молекулярная биология) научных журналах.
Краткая трудовая биография:
Семисотнов Геннадий Васильевич, работает в Институте белка РАН с 1975 года, после окончания физического факультета Ленинградского государственного университета. Его научная карьера начиналась с должности стажера-исследователя и включала все последующие этапы: учеба в аспирантуре, защита кандидатской диссертации (в 1982 году), работа в качестве младшего научного сотрудника, научного сотрудника, старшего научного сотрудника и ведущего научного сотрудника (после защиты докторской диссертации в 1995 году). За это время он подготовил 12 кандидатов наук и в 2012 году удостоен ученого звания «профессор» по специальности «биофизика». В настоящее время он является одним из ведущих специалистов (экспертов) в области экспериментальных исследований стабильности и сворачивания белков in vitro. Индекс цитирования его публикаций с 1975 года по настоящее время (71) составляет 3500, а индекс Хирша равен 16 по данным Web of Science.
Тутукина Мария, кандидат биологических наук
Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Преподаваемая дисциплина: Молекулярные методы клеточной биологии
Scientific interests: Functional and comparative genomics of bacteria, Untranslated RNAs and their evolution; evolution of bacterial genomes, Transcriptional regulation, Bioinformatics and computational biology.
Education
2009 PhD in Molecular Biology, Institute of Cell Biophysics RAS, Pushchino, Moscow
2006-2009 PhD Student at the Department of Functional Genomics and Cellular Stress, Institute of Cell Biophysics Russian Academy of Sciences
2000-2006 Student of Voronezh State University, Faculty for Biology and Soil Science
2006 MSc in Biochemistry, Department of Cell Biochemistry and Physiology, VSU, Voronezh, Russia, and Department of Functional Genomics and Cellular Stress, Institute of Cell Biophysics RAS, Pushchino, Russia.
2004 BSc in Biochemistry, Department of Cell Biochemistry and Physiology, VSU, Voronezh, Russia (1st Class Honour degree)
In parallel:
2003-2006 Student of Voronezh State University, Faculty for Chemistry
2006 Diploma in Physical Chemistry (1st Class Honour degree).
Honours/Awards
1st prize winner of the IХ International Conference «Biology is the science of ХХI century» (Pushchino, Russia, 2005) (Talk)
EMBO award for the outstanding poster presentation on the Conference “Genomes 2008: Functional genomics of microorganisms” (Paris, France, 2008).
Grants/Fellowships
(2014) PI of the RFBR research grant 15-04-08716
(2012) PI of the RFBR research grant 12-04-01830
(2010-2011) FEMS research fellowship (FRF 2010-2)
(2013, 2011, 2009, 2008) FEMS young scientist grants
(2010, 2009, 2008) RFBR travel grants
(2010, 2008) EMBL Conference “From Functional genomics to systems biology” travel fellowship; EMBL-Heidelberg, Germany
(2010) Robert-Bosch-Stiftung Fellowship for the EMBO Meeting 2010; Barcelona, Spain
(2009) 34th FEBS Congress travel fellowship; Prague, Czech Republic
Internships and collaborations
(2011-present) Laboratory of Molecular Microbiology, School of Biosciences, University of Birmingham, UK (Prof. Jeff Cole, Prof. Steve Busby, Dr. Dave Grainger)
(2013-present) Evolutionary Genomics, Bioinformatics and Genomics Programme, Centre for Genomic Regulation-CRG, Barcelona, Spain (Dr. Fyodor Kondrashov)
Research experience
General gene engineering techniques such as DNA and RNA purification, PCR, qRT-PCR, RACE, molecular cloning and sequencing of DNA, RNA-seq;
Promoter activity testing in vitro and in vivo;
Western, Southern and Northern blotting analysis;
Chromatin immunoprecipitation, ChIP-seq;
Protein expression in E. coli and its purification;
Methods of bioenergetics;
Electrochemical methods (voltammetry, rotating disk electrode technique);
Computer modelling and comparative genomics.
Teaching experience
2014-present lecture course: "Molecular methods in Cell biology ", Pushchino State Institute
2012-2016 Courses on biochemistry and molecular biology at the School of Theoretical and Molecular Biology (Pushchino, 2012-2015, Barcelona, 2016)
Supervising: 1 PhD project (defended in 2016) and 2 MS projects (2013-2014 and 2016-2017)
Membership
FEMS
FEBS
Interregional Russian Microbiological Society
List of publications
1. MV Zakharchenko, AV Zakharchenko, NV Khunderyakova, MN Tutukina, MA Simonova, AA Vasilieva, OI Romanova, NI Fedotcheva, EG Litvinova, EI Maevsky, VP Zinchenko, AV Berezhnov, IG Morgunov, AA Gulayev, MN Kondrashova Burst of succinate dehydrogenase and α-ketoglutarate dehydrogenase activity in concert with the expression of genes coding for respiratory chain proteins underlies short-term beneficial physiological stress in mitochondria. // The International Journal of Biochemistry and Cell Biology – 2012 - http://dx.doi.org/10.1016/j.biocel.2012.07.003
2. I. V. Trubitsyn, Zh. G. Andreevskikh, L. I. Yurevich, E. V. Belousova, M. N. Tutukina, А.Y. Merkel, G. A. Dubinina, M. Yu. Grabovich Capacity for nitrate respiration as a new aspect of metabolism of the filamentous sulfur bacteria of the genus Thiothrix.// Microbiology. – 2013 – V.82, №1. – p.15-21.
3. Potapova A.V., Ozoline O.N., Tutukina M.N. Development of effective overproduction and purification approaches for the ExuR transcription factor of Escherichia coli.// Sorption and Chromatographic Processes – 2014- 14 (3). – p. 537-543. (In Russian)
4. Yu.A. Purtov, O.A. Glazunova, S.S. Antipov, V.O. Pokusaeva, E.E. Fesenko, E.V. Preobrazhenskaya, K.S. Shavkunov, M.N. Tutukina, V.I. Lukyanov, O.N. Ozoline Promoter islands as a platform for interaction with nucleoid proteins and transcription factors // J. of Bioinf. and Comp. Biology – 2014
5. Trubitsyn I.V., Belousova E.V., Tutukina M.N., Merkel A.Yu., Dubinina G.A., Grabovich M.Yu. Expansion of ability to anaerobic respiration on nitrates within the filamentous colourless sulphur bacteria of the genus Thiothrix. // FEMS Microbiol Lett. – 2014 -Sep;358(1):72-80. doi: 11.1111/1574-6968.12548.
6. Krivushin K, Kondrashov F, Shmakova L, Tutukina M, Petrovskaya L, Rivkina E. Two metagenomes from late pleistocene northeast siberian permafrost. // Genome Announc. -2015 -Jan 2;3(1). pii: e01380-14. doi: 10.1128/genomeA.01380-14.
7. Melekhov VV, Shvyreva US, Timchenko AA, Tutukina MN, Preobrazhenskaya EV, Burkova DV, Artiukhov VG, Ozoline ON, Antipov SS. Modes of Escherichia coli Dps Interaction with DNA as Revealed by Atomic Force Microscopy. // PLoS One. – 2015 - May 15;10(5):e0126504. doi: 10.1371/journal.pone.0126504.
8. Shvyreva U.S., Tutukina M.N. Ozoline O.N. «Promoter islands» of the E. coli genome as targets for sorption of the RNA processing enzymes. // Sorption and Chromatographic Processes- 2015 -Т. 15. № 4. – p. 586-594.
9. Tutukina M.N., Shvyreva U.S., Ozoline O.N. Architectural factor of bacterial nucleoid, H-NS: overproduction and verification of its functional activity. // Sorption and Chromatographic Processes- 2015 - Т. 15. № 3. – p. 435-442.
10. Tutukina MN, Potapova AV, Vlasov PK, Purtov YA, Ozoline ON. Structural Modeling of the ExuR and UxuR Transcription Factors of E. coli: Search for the Ligands Affecting their Regulatory Properties. // J Biomol Struct Dyn. – 2016 - Oct;34(10):2296-304. doi: 10.1080/07391102.2015.1115779.
11. Tutukina MN, Potapova AV, Cole JA, Ozoline ON. Control of hexuronate metabolism in Escherichia coli by the two interdependent regulators, ExuR and UxuR: derepression by heterodimer formation. // Microbiology. – 2016 - Jul;162(7):1220-31. doi: 10.1099/mic.0.000297.
12. Orlova MV, Tarlachkov SV, Dubinina GA, Belousova EV, Tutukina MN, Grabovich MY. Genomic insights into metabolic versatility of a lithotrophic sulfur-oxidizing diazotrophic Alphaproteobacterium Azospirillum thiophilum. // FEMS Microbiol Ecol. – 2016 - Dec;92(12). pii: fiw199.
13. Bessonova T.A., Shumeyko S.A., Purtov Yu. A., Antipov S.S., Preobrazhenskaya E.V., Tutukina M.N., Ozoline O.N. Hexuronates influence the oligomeric form of the Dps structural protein of bacterial nucleoid and its ability to bind linear DNA fragments.// Biofizika – 2016 – 61(6) – p. 1059-1067.
14. Elizaveta Rivkina, Lada Petrovskaya, Tatiana Vishnivetskaya, Kirill Krivushin, Lyubov Shmakova, Maria Tutukina, Arthur Meyers, Fyodor Kondrashov. Metagenomic analyses of the late Pleistocene permafrost – additional tools for reconstruction of environmental conditions // Biogeosciences – 2016 – 13 – p. 2207-2219. doi:10.5194/bg-13-2207-2016
Фесенко Евгений Евгеньевич, член-корреспондент РАН
Декан факультета биологии клетки
Телефон: +7 (496) 773-92-32
Факс: +7 (496) 779-05-09
E-mail: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Основные публикации за последние 5 лет:
Новиков В.В., Яблокова Е.В., Фесенко Е.Е. Роль ионов кальция в праймировании респираторного взрыва в нейтрофилах при действии комбинированных магнитных полей с очень слабой переменной низкочастотной компонентой В книге: Космос и биосфера Тезисы докладов XII Международной крымской конференции, посвященной 100-летию Крымского федерального университета имени В.И. Вернадского, 120-летию А.Л. Чижевского, 100-летию В.А. Троицкой и 130-летию П.М. Нагорского. 2017. С. 125-127.
Новиков В.В., Яблокова Е.В., Новиков Г.В., Фесенко Е.Е. Роль липидной пероксидации и миелопероксидазы в праймировании респираторного взрыва в нейтрофилах при действии комбинированных постоянного и переменного магнитных полей
Биофизика. 2017. Т. 62. № 5. С. 926-931.
Новиков В.В., Яблокова Е.В., Фесенко Е.Е. Действие слабых магнитных полей на хемилюминесценцию крови человека
Биофизика. 2016. Т. 61. № 1. С. 126-130.
Шарапов М.Г., Гудков С.В., Гордеева А.Е., Карп О.Э., Иванов В.Е., Шелковская О.В., Брусков В.И., Новоселов В.И., Фесенко Е.Е. Пероксиредоксин 6 – природный радиопротектор. Доклады Академии наук. 2016. Т. 467. № 3. С. 355.
Варламова Е.Г., Гольтяев М.В., Фесенко Е.Е. Экспрессия генов селенопротеинов человека в опухолевых клеточных линиях. Доклады Академии наук. 2016. Т. 468. № 4. С. 456.
Gordeeva A.E., Sharapov M.G., Fesenko E.E., Novoselov V.I., Temnov A.A., Charnagalov A.A. Protective effect of peroxiredoxin 6 in ischemia/reperfusion-induced damage of small intestine.Digestive Diseases and Sciences. 2015. Т. 60. № 12. С. 3610-3619.
Новиков В.В., Яблокова Е.В., Фесенко Е.Е. Действие комбинированных магнитных полей с очень слабой переменной низкочастотной компонентой на люминолзависимую хемилюминесценцию крови млекопитающих. Биофизика. 2015. Т. 60. № 3. С. 530-533.
Шишова Н.В., Фесенко Е.Е. Перспективы использования газов и газовых гидратов в криоконсервации. Биофизика. 2015. Т. 60. № 5. С. 947-974.
Глушкова О.В., Хренов М.О., Новосёлова Т.В., Лунин С.М., Фесенко Е.Е., Новосёлова Е.Г. Роль протеинкиназы ск2 в стрессовом ответе макрофагов raw 264.7. Доклады Академии наук. 2015. Т. 464. № 4. С. 505.
Novoselova E.G., Lunin S.M., Khrenov M.O., Parfenyuk S.B., Novoselova T.V., Fesenko E.E., Shenkman B.S. Changes in immune cell signalling, apoptosis and stress response functions in mice returned from the bion-m1 mission in space. Immunobiology. 2015. Т. 220. № 4. С. 500-509.
Lunin S.M., Khrenov M.O., Novoselova T.V., Parfenyuk S.B., Glushkova O.V., Fesenko E.E., Novoselova E.G. Modulation of inflammatory response in mice with severe autoimmune disease by thymic peptide thymulin and an inhibitor of nf-kappab signaling. International Immunopharmacology. 2015. Т. 25. № 2. С. 260-266.
Zhadobov M., Sauleau R., Alekseev S.I., Fesenko E.E., Le Dréan Y. Millimeter waves as a source of selective heating of skin. Bioelectromagnetics. 2015. Т. 36. № 6. С. 464-475.
Penkov N., Shvirst N., Yashin V., Fesenko E. Terahertz spectroscopy applied for investigation of water structure. Journal of Physical Chemistry B: Biophysical Chemistry, Biomaterials, Liquids, and Soft Matter. 2015. Т. 119. № 39. С. 12664-12670.
Goltyaev M.V., Varlamova E.G., Novoselov V.I., Fesenko E.E. Determination of mgpx6 and mselv gene mrna expression during mouse postnatal development. Doklady Biochemistry and Biophysics. 2014. Т. 457. № 1. С. 132-133.
Новоселова Т.В., Глушкова О.В., Парфенюк С.Б., Хренов М.О., Лунин С.М., Смолихина Т.И., Фесенко Е.Е., Новоселова Е.Г.Влияние in vitro и in vivo ряда ингибиторов сигнальный каскадов на продукцию цитокинов и сигнальные белков в макрофагах raw 264.7 и в лимфоцитаx мышей. Биофизика. 2014. Т. 59. № 1. С. 112-117.
Пеньков Н.В., Яшин В.А., Швирст Н.Э., Фесенко Е.Е.М., Фесенко Е.Е. Об особенностях температурных зависимостей спектров воды в терагерцовой области частот. Биофизика. 2014. Т. 59. № 2. С. 271-273.
Храмцова Е.А., Межевикина Л.М., Фесенко Е.Е. Роль клеток трофобласта в регуляции выживаемости бластоцист мыши in vitro после микроинъекции и осмотического шока. Биофизика. 2014. Т. 59. № 2. С. 314-321.
Лобанок Е.С., Квачева З.Б., Пинчук С.В., Волк М.В., Межевикина Л.М., Фесенко Е.Е., Волотовский И.Д. Влияние фактора роста фибробластов fgf2 на кардиомиоцитарную дифференцировку мезенхимальных стволовых клеток костного мозга eх vivo. Биофизика. 2014. Т. 59. № 2. С. 360-368.
Пеньков Н.В., Яшин В.А., Фесенко Е.Е.М., Фесенко Е.Е. Расчет количества свободных молекул воды в водных растворах с помощью спектральных параметр ов из терагерцовой области с учетом процессов экранировки. Биофизика. 2014. Т. 59. № 3. С. 428-431.
Полешко А.Г., Лобанок Е.С., Межевикина Л.М., Фесенко Е.Е., Болотовский И.Д. Процесс гемообразования в мезенхимальных стволовых клетках костного мозга при их культивировании с фактором роста фибробластов bfgf в условиях гипоксии. Биофизика. 2014. Т. 59. № 6. С. 1125-1130.
Новиков В.В., Шейма И.М., Яблокова Е.В., Фесенко Е.Е. Модулирующее действие слабых комбинированных магнитных полей на продолжительность метаморфоза мучного хрущака tenebrio molitor. Биофизика. 2014. Т. 59. № 6. С. 1157-1160.
Гольтяев М.В., Варламова Е.Г., Новосёлов В.И., Фесенко Е.Е. Определение уровня экспрессии мрнк генов mgpx6 и mselv в процессе постнатального развития мыши. Доклады Академии наук. 2014. Т. 457. № 2. С. 239.
Новосёлова Е.Г., Хренов М.О., Парфенюк С.Б., Новосёлова Т.В., Лунин С.М., Фесенко Е.Е. Роль сигнальных каскадов nf-width="8" height="7" /> b, irf3 и sapk/jnk в иммунных клетках животных при развитии сахарного диабета типа 1. Доклады Академии наук. 2014. Т. 457. № 3. С. 360.
Грядунов Д.А., Зименков Д.В., Кулагина Е.В., Лейнсоо А.Т., Фесенко Е.Е., Шаскольский Б.Л., Гейдаров Р.Н.О., Дементьева Е.И., Михайлович В.М., Заседателев А.С. Комплексный анализ возбудителей инфекционных заболеваний на платформе гидрогелевых биочипов. Клиническая лабораторная диагностика. 2014. Т. 59. № 9. С. 75-76.
Волкова А.Г., Шарапов М.Г., Равин В.К., Гордеева А.Е., Карадулева Е.В., Мубаракшина Э.К., Темнов А.А., Фесенко Е.Е., Новоселов В.И. Эффект различных ферментов-антиоксидантов на регенеративные процессы в эпителии трахеи после химического ожога. Пульмонология. 2014. № 2. С. 84-90.
Purtov Y.A., Glazunova O.A., Antipov S.S., Fesenko E.E., Shavkunov K.S., Tutukina M.N., Ozoline O.N., Pokusaeva V.O., Preobrazhenskaya E.V., Lukyanov V.I. Promoter islands as a platform for interaction with nucleoid proteins and transcription factors. Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 2014. Т. 12. № 2. С. 1441006.
Kondratyev M.S., Lunin S.M., Kabanov A.V., Samchenko A.A., Komarov V.M., Fesenko E.E., Novoselova E.G. Structural and dynamic properties of thymopoietin mimetics. Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. 2014. Т. 32. № 11. С. 1793-1801.
Novoselova E.G., Khrenov M.O., Glushkova O.V., Lunin S.M., Parfenyuk S.B., Novoselova T.V., Fesenko E.E. Anti-inflammatory effects of ikk inhibitor xii, thymulin, and fat-soluble antioxidants in lps-treated mice. Mediators of Inflammation. 2014. Т. 2014. С. 724838.
Алексеев С.И., Зискин М.С., Фесенко Е.Е. Механизмы противоболевого действия миллиметровых волн. Биомедицинская радиоэлектроника. 2014. № 6. С. 55-65.
Гордеева А.Е., Шарапов М.Г., Новоселов В.И., Фесенко Е.Е., Темнов А.А., Хубутия М.Ш. Влияние пероксиредоксина vi на сохранение тонкой кишки крысы при ишемии/реперфузии. Трансплантология. 2014. № 4. С. 21-27.
Kolomiytseva I.K., Perepelkina N.I., Fesenko E.E. Lipids of liver membrane structures during hibernation of the arctic ground squirrel spermophilus undulates. Doklady Biochemistry and Biophysics. 2013. Т. 448. № 1. С. 15-18.
Пеньков Н.В., Швирст Н.Э., Яшин В.А., Фесенко Е.Е. Расчет доли свободных молекул воды в водных растворах с помощью спектрального анализа. Биофизика. 2013. Т. 58. № 6. С. 942-946.
Коломийцева И.К., Перепелкина Н.И., Фесенко Е.Е. Липиды мембранных структур печени при гибернации якутского суслика spermophylus undulatus. Доклады Академии наук. 2013. Т. 448. № 3. С. 351.
Парфенюк С.Б., Глушкова О.В., Хренов М.О., Новосёлова Т.В., Лунин С.М., Фесенко Е.Е., Новосёлова Е.Г. Диета с липорастворимыми антиоксидантами защищает иммунные клетки мышей от токсического действия атмосферных примесей аммиака. Доклады Академии наук. 2013. Т. 449. № 6. С. 722.
Варламова Е.Г., Гольтяев М.В., Новосёлов С.В., Новосёлов В.И., Фесенко Е.Е. Биосинтез и механизм встраивания селеноцистеина в синтезируемые белки. Молекулярная биология. 2013. Т. 47. № 4. С. 558.
Варламова Е.Г., Гольтяев М.В., Новоселов С.В., Новоселов В.И., Фесенко Е.Е. Характеристика некоторых представителей суперсемейства тиоловых оксидоредуктаз. Молекулярная биология. 2013. Т. 47. № 4. С. 568.
Lunin S.M., Glushkova O.V., Khrenov M.O., Novoselova T.V., Parfenyuk S.B., Fesenko E.E., Novoselova E.G. Thymic peptides restrain the inflammatory response in mice with experimental autoimmune encephalomyelitis. Immunobiology. 2013. Т. 218. № 3. С. 402-407.
Glushkova O.V., Parfenyuk S.B., Khrenov M.O., Novoselova T.V., Lunin S.M., Fesenko E.E., Novoselova E.G. Inhibitors of tlr-4, nf-κb, and sapk/jnk signaling reduce the toxic effect of lipopolysaccharide on raw 264.7 cells. Journal of Immunotoxicology. 2013. Т. 10. № 2. С. 133-140.
Шавкунов Константин Сергеевич, кандидат биологических наук
Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Преподаваемая дисциплина: Молекулярные методы клеточной биологии
Основные публикации за последние 5 лет:
- Bykov A.A., Shavkunov K.S., Panyukov V.V., Ozoline O.N. Bacterial nucleoid protein Dps binds to structured RNA molecules. // Mathematical Biology and Bioinformatics. - 2017. - V.12(S), P. t1–t11. - doi: 10.17537/2017.12t1.
- Glazunova O.A., Shavkunov K.S., Tutukina M.N., Panyukov V.V., Ozoline O.N. Integration of foreign genetic material provokes local mutagenesis in the recipient genome. // Mathematical Biology and Bioinformatics. - 2017. - V. 12(S). - P. t12–t22. - doi: 10.17537/2017.12.t12.
- Kiselev S.S., Ozoline O.N., Glazunova O.A., Panyukov V.V., Shavkunov K.S. Novel elements of bacterial genomes – promoter islands: intraspecies polymorphism and sequence stability. // Current Bioinformatics. - 2017. - V.12. - P. 194-201. - doi: 10.2174/1574893612666170321144558.