Факультет биологии клетки

Новоселов Владимир Иванович, доктор биологических наук, профессор

Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.

Преподаваемая дисциплина: Молекулярные механизмы сенсорной рецепции

Главный научный сотрудник Института биофизики клетки РАН

Научные интересы: защитные системы организма, антиоксидантные системы, создание лекарственных препаратов нового поколения.

Основные публикации за последние 5 лет:
1. Варламова Е.Г. Новоселов В.И. Поиск партнеров нового селенового белка млекопитающих (SelV) 
и экспрессия его мРНК в процессе онтогенеза и сперматогенеза. Молекулярная биология, 2012, 46(2), 276-284
2. Новоселов В.И. Роль пероксиредоксинов при окислительном стрессе в органах дыхания.
Обзор. Пульмонология, 2012, Том 10 (1), стр. 80-88
3. Novoselov V.I. Sharapov M, Volkova A., Mubarakshina E., Antioxidant systems in rat trachea
upon thermal and chemical burns of upper airway. Eur. Respir. J., 2013, Volume 42, р.85S.
4. Варламова Е.Г., Гольтяев М.В., Новоселов С.В., Новоселов В.И., Фесенко Е.Е. 
Характеристика некоторых представителей суперсемейства тиоловых оксиредуктаз Молекулярная биология, 2013, т. 47, №4, 568-582.
5. Варламова Е.Г., Гольтяев М.В., Новоселов С.В., Новоселов В.И., Фесенко Е.Е. 
Биосинтез и механизм встраивания селенцистеина в синтезируемые белки. Молекулярная биология, 2013, 47(4), 558-567
6. Волкова А.Г., Шарапов М.Г., Равин В.К., Гордеева А.Е. , Карадулева Е.A., Мубаракшина Э.К., Темнов А.А.,
Фесенко Е.Е., Новоселов В.И. Эффект различных ферментов-антиоксидантов на регенеративные процессы
в эпителии трахеи после химического ожога. Пульмонология, 2014, 12 (2), 84-90
7. Шарапов М.Г., Равин В.К., Новоселов В.И. Пероксиредоксины – многофункциональные ферменты.
2014. Молекулярная биология, 48, 4, 600-628
8. Gordeeva A.E., Sharapov M.G., Temnov A.A, Novoselov V.I. The effects of Peroxiredoxin VI on the preservation
of the small intestine in rats after ischemia/reperfusion damage. News of Science and Education. 2014, 12(12), 44-51.
9. Гордеева А.Е., Шарапов М.Г., Новоселов В.И., Фесенко Е.Е., Темнов А.А., Хубутия М.Ш. 
Влияние пероксиредоксина VI на сохранение тонкой кишки при ишемии/реперфузии. 2014. Трансплантология, 8, №4, стр. 21-27.
10. Гольтяев М.В., Е. Г. Варламова, В. И. Новосёлов, Е. Е. Фесенко. Определение уровня экспрессии мРНК
генов mgpx6 и mselv в процессе постнатального развития мышы. 2014 г. Докл. Акад. наук, 2014, 457(2), 239-240
11. Grigoriev P.A., Sharapov M.G., Novoselov V.I. Properties of ion channels formed by peroxiredoxin-6 in the lipid bilayers:
cluster channel inactivation. J.Bio.Phys.Chem. 2014, v.14, pp.1- 3, Doi:10.5402/2012/204104
12. Хубутия М.Ш., Вагабов А.В., Темнов А.А., Абрамов В.Ю., Новоселов В.И., Склифас А.Н., Кукушкин Н.И.
Применение мезенхимальных стволовых клеток способствует уменьшению степени ишемически-реперфузионного
поражения различных органов в эксперименте: акцент на паракринные механизмы. Нефрология и диализ. 2014, 16(4), 418-424.
13. Гордеева А.Е.1, Кочкина А.В., Карадулева Е.В., Новоселов В.И. Распределение экзогенных ферментов-антиоксидантов
в организме при свободно-радикальных патологияхю. Международный научно-исследовательский журнал 2015, 40(3), 6-10
14. Варламова Е.Г., Новоселов С.В., Новоселов В.И. cDNA клонирование, экспрессия и определение субстратной специфичности 
мышинового селен-содержащего белка SelV (Selenoprotein V)]. Молекулярная биология 2015, 49(5), 785-789.
15. Григорьев П.А., Шарапов М.Г., Новоселов В.И. Потенциал-зависимая катионная селективность ионных каналов, 
образованных пероксиредоксином 6 в липидном бислое. Биофизика, 2015, 60(4):696-699. 
16. Палутина О.А., Шарапов М.Г., Темнов А.А., Новоселов В.И. Нефропротективный эффект экзогенных ферментов-антиоксидантов
при ишемически-реперфузионном повреждении тканей почки. Бюлл.эксп.биол.мед. 2015, 160(9), 305-310.
17. Gordeeva A.E., Temnov A.A., Charnagalov A.A., Sharapov M.G., Fesenko E.E., Novoselov V.I. Protective effect of peroxiredoxin 6
in ischemia/reperfusion-induced damage of the small intestine. Dig.Dis.Sci., 2015, vol. 60, № 12, pp.3610-3619.
18. Е.В.Карадулева, Э.К.Мубаракшина, М.Г.Шарапов, А.Е.Волкова, О.Ю.Пименов, В.К.Равин, Ю.М.Кокоз, В.И.Новоселов. 
Кардиопротекторный эффект модифицированных пероксиредоксинов при ретроградной перфузии изолированного сердца крысы 
в условиях окислительного стресса. Бюлл.эксп.биол.мед. 2015, 160(11), 584-588.
19. Терещенко А.В., Темнов А.А., Кодунов А.М., Нечеснюк С.Ю., Склифас А.Н., Новоселов В.И., Демьянченко С.К. 
Лечение термического ожога роговицы препаратом пептидов в эксперименте.
Катарактальная и рефракционная хирургия. 2015, 15(4), 44-50. 
20. Шарапов М.Г., Новоселов В.И., Равин В.К. Получение химерного, совмещеющего активности супероксиддисмутазы и пероксида. 
Биохимия, 2016, 81(4), 571-579. 
21. Шарапов М.Г., Гудков С.В., Гордеева А.Е., Карп О.Э., Иванов В.Е., Шелковская О.В., Брусков В.И., Новоселов В.И., Фесенко Е.Е.
Пероксиредоксин 6 – природный радиопротектор. ДАН, 2016, 467(3), 355-358.
22. A.A. Temnov, A.V. Vagabov, A.N. Sklifas, V.I. Novoselov, and Y.A. Belyi. The role of mesenchymal stromal cells in the repair of acute organ injury. 
In: The Biology and Therapeutic Application of Mesenchymal Cells – Set. (Kerry Atkinson, Editor). 2017, pp.496-523, 
Wiley-Blackwell, USA. ISBN: 978-1-118-90751-1
23. Gordeeva A., Sharapov M., Tikhonova I., Chemeris N., Fesenko E., Novoselov V., Temnov A. Vascular pathology in ischemia/reperfusion-induced
damage of small intestine of rat. Cell Tissues Organs. 2017, 203 (6):353-364.
24. Кочкина А.В., Рогов К.А., Шарапов М.Г., Евдокимов В.А., Музафаров Е.Н., Новоселов В.И., Мелерзанов А.В., Темнов А.А.
Влияние пероксиредоксинов и паракринных факторов мезенхимальных стволовых клеток на заживление полнослойной кожанной раны.
Клиническая и экспериментальная морфология. 2017, 2(22), 52-58.

Образование:
Ростовский государственный университет, 1969 г., физический факультет

Стаж работы преподавателем: Профессор ПущГЕНИ с 1995г.

Премии и награды:
Медаль - 850 лет Москве
Орден Губернатора Московской области - «Научная династия»
Грамота Президиума РАН

Победы в грантах и научных проектах:
1. ФЦП «Научные и научно-технические кадры инновационной России» «Разработка адресной доставки лекарственных препаратов мощного антиоксидантного действия на основе пероксиредоксинов для терапии ишемии и инфаркта миокарда». ГК. № 02.740.11.0387
2. ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям 
развития научно-технического комплекса России на 2007-2013 годы» "Разработка способов получения высокоэффективных продуцентов ферментов, синергически сочетающих пероксидазную и супероксиддисмутазную активности, для создания нового класса лекарственных препаратов для лечения заболеваний, сопровождающихся окислительным стрессом". ГК № 16.512.11.2169
3. Программа Президиума РАН "Молекулярная и клеточная биология", Фундаментальная социально ориентированная тематика. «Исследование влияния модифицированных рекомбинантных форм пероксиредоксина 6 и различных способов его доставки на эффективность лечения воспалительных процессов различной этиологии с целью создания новых лекарственных препаратов». Регистрационный номер НИОКР 01200962096. 
4. Программа Секции прикладных исследований при Президиуме РАН. «Исследование по оценке природных антиоксидантных систем покровных тканей для разработки противоожоговых средств защиты органов дыхания и кожи», шифр «Аравана», договор № 1437 от 18.03.2005 г. 
5. Программа Президиума РАН "Молекулярная и клеточная биология", Фундаментальная социально ориентированная тематика. «Создание новых типов антивоспалительных лекарственных препаратов эндотелий-протекторного и иммуномодулирующего действия на основе модифицированных ферментов-антиоксидантов и тимусных пептидов». Регистрационный номер НИОКР: 01201359149
6. РФФИ 96-04-48161-а. Молекулярные механизмы функционирования обонятельных рецепторов позвоночных, (1996-1998) 
7. РФФИ 99-04-48170-а. Молекулярные механизмы функционирования обонятельного анализатора позвоночных, (1999-2000) 
8. РФФИ 01-04-48183-а. Молекулярные механизмы функционирования обонятельного анализатора млекопитающих, (2001-2003)
9. РФФИ 04-04-48397-а. Молекулярные механизмы функционирования защитных систем эпителиальных тканей, (2004-2006)
10. РФФИ 08-04-00707-а. Идентификация белков, взаимодействующих с секреторными белками обонятельного и респираторного эпителиев, (2008-2010)
11. РФФИ 13-04-00537. Исследование эндотелий-протекторных эффектов химерных ферментов с совмещенными пероксидазной и супероксиддисмутазной активностями на изолированных органах. (2013-2015)
12. РФФИ 17-04-00356. Исследование молекулярных механизмов нефропротекторного действия экзогенных пероксиредоксинов и их модифицированных форм на модели острой почечной недостаточности у мыши.

Индекс Хирша:
13 (WEB of Science), 10 (РИНЦ)

Участие в редколлегии журналов:
Член коллегии ВАК (биологические науки)
Эксперт Президиума РАН

Краткая трудовая биография:
1969-1990 гг.
Стажер-исследователь, старший лаборант, инженер, младший научный сотрудник, старший научный сотрудник Института биофизики клетки АН СССР
1991 г. - по настоящее время
Ведущий научный сотрудник, главный научный сотрудник Института биофизики клетки РАН

Семисотнов Геннадий Васильевич, профессор, доктор физико-математических наук

Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.

Преподаваемая дисциплина: Физические методы в молекулярной биофизике

Должность в институте: ведущий научный сотрудник

Научные интересы: структура, стабильность и самоорганизация белков, молекулярные шапероны, белок-белковые взаимодействия, оптическая спектроскопия

Основные публикации за последние 5 лет:

1. Guryanov S.G, Filimonov V.V., Timchenko A.A., Melnik B.S., Kihara H., Kutyshenko V.P., Ovchinnikov L.P., Semisotnov G.V. The major mRNP protein YB-1: structural and association properties in solution. Biochim Biophys Acta. 2013; 1834(2):559-67.

2. Рябова Н.А., Марченков В.В., Марченкова С.Ю., Котова Н.В., Семисотнов Г.В. Молекулярный шаперон GroEL/ES: процессы денатурации и ренатурации. Усп Биол Хим. 2013; 53:59-80.

3. Ryabova N., Marchenkov V., Kotova N., Semisotnov G. Chaperonin GroEL reassembly: an effect of protein ligands and solvent composition. Biomolecules. 2014; 4(2):458-73.

4. Marchenko N.Y., Marchenkov V.V., Semisotnov G.V., Finkelstein A.V. Strict experimental evidence that apo-chaperonin GroEL does not accelerate protein folding, although it does accelerate one of its steps. Proc Natl Acad Sci U S A. 2015; 112(50):E6831-2.

5. Marchenko N.Y., Sikorskaya E.V., Marchenkov V.V., Kashparov I.A., Semisotnov G.V. Affinity chromatography of chaperones based on denatured proteins: Analysis of cell lysates of different origin. Protein Expr Purif. 2016; 119:117-23.

Образование:
Ленинградский государственный университет, 1975, физик/биофизик.
Аспирантура в Институте белка РАН, защита кандидатской диссертации физ.-мат. наук, 1982.
Защита докторской диссертации физ.-мат. наук, 1995.

Стаж работы преподавателем: 5 лет

Победы в грантах и научных проектах:
Активно участвовал в качестве ответственного исполнителя ряда престижных международных проектов, финансируемых фондами HFPS (1992-1994), HHMI (1995-2005). Неоднократно являлся руководителем проектов РФФИ (1994-1996, 1997-1999, 2000-2002, 2003-2005, 2004-2006, 2009-2011) и ответственным исполнителем РНФ (2014-2016, 2017-2018), МКБ (2013-2017), Госконтракта с Минобрнауки (2009-2011).

Индекс Хирша: 16

Участие в редколлегии журналов: В качестве приглашенного рецензента постоянно участвует в рецензиях научных публикаций как в иностранных (Biochemistry, Biochemia, European Biophysical Journal, FEBS Letters), так и в отечественных (Биохимия, Биофизика, Молекулярная биология) научных журналах.

Краткая трудовая биография:
Семисотнов Геннадий Васильевич, работает в Институте белка РАН с 1975 года, после окончания физического факультета Ленинградского государственного университета. Его научная карьера начиналась с должности стажера-исследователя и включала все последующие этапы: учеба в аспирантуре, защита кандидатской диссертации (в 1982 году), работа в качестве младшего научного сотрудника, научного сотрудника, старшего научного сотрудника и ведущего научного сотрудника (после защиты докторской диссертации в 1995 году). За это время он подготовил 12 кандидатов наук и в 2012 году удостоен ученого звания «профессор» по специальности «биофизика». В настоящее время он является одним из ведущих специалистов (экспертов) в области экспериментальных исследований стабильности и сворачивания белков in vitro. Индекс цитирования его публикаций с 1975 года по настоящее время (71) составляет 3500, а индекс Хирша равен 16 по данным Web of Science.

Авхачёва Надежда Владимировна, кандидат биологических наук

Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.

Преподаваемая дисциплина:
Стресс и механизмы клеточной адаптации, Клеточный цикл, рост и движение клеток

Учёный секретарь Института биофизики клетки РАН

Научные интересы: Редокс-сигнализация в различных типах клеток

Основные публикации за последние 5 лет:

Список монографий:
Авхачева Н.В. Изменение системы врожденного иммунитета в организме-опухоленосителя. 
Использование системного подхода для оценки состояния клеток врожденного иммунитета при развитии опухоли в организме. 
LAP LAMBERT Academic Publishing GmbH & Co. KG. 2011. 145 стр. ISBN: 978-3-8433-1380-3. 
Глава в монографии Л.В. Ванько, В.Г. Сафронова, Н.К. Матвеева, Г.Т. Сухих. 
«Оксидативный стресс в генезе акушерских осложнений».
Глава 1 «Клеточные и молекулярные основы генерации активных форм кислорода».
ООО Издательская группа «ГЭОТАРМедиа», 2010. ISBN 978-5-9704-1717-1
Список статей:
Permyakov, S. E.; Kazakov, A.S.; Avkhacheva, N.V.; Permyakov E.A.
Parvalbumin as a metal-dependent antioxidant. CELL CALCIUM. 2014. 55: 261-268.
Mal’tseva V. N., Avkhacheva N. V., Safronova V. G. Common regularities in changes of the neutrophil functional activity during
in vivo growth of tumors of different immunogenic activity. Bulletin of Experimental Biology and Medicine, Vol. 150, No. 5, March, 2011
Karpukhin A.V., Avkhacheva N.V., Yakovlev R.Yu., Kulakova I.I., Yashin V.A., Lisichkin G.V., Safronova V.G. 
Effect of detonation nanodiamonds on phagocyte activity. Cell Biol Int. 2011. 35(7):727-33.

Образование: Пущинский государственный университет, специальность Биология

Стаж работы преподавателем: 8 лет

Премии и награды: 
Победы в грантах и научных проектах: гранты РФФИ 14-04-31708 (Р), 16-04-00226 (Р)

Индекс Хирша: 6

Краткая трудовая биография: 

Образование:
2010 Повышение квалификации, Преподаватель Высшей школы, 
Институт развития дополнительного профессионального образования
2003-2008: r.б.н., Лаборатория клеточной нейробиологии, Институт Биофизики клетки РАН, Россия
2003-2001: Магистр биологии, Пущинский государственный университет, кафедра Биологии клетки/Пущино, Россия
1996-2001: Бакалавр биологии, Воронежский государственный университет,
Биолого-почвенный факультет, кафедра биофизики и биотехнологии/Воронеж, Россия

Стаж работы:
2016-наст. время учёный секретарь 
Института биологического приборостроения с опытным производством РАН, Пущино, Россия
2015-2016: помощник учёного секретаря (руководство аспирантурой) 
Института биологического приборостроения с опытным производством РАН, Пущино, Россия
2010-2016: старший научный сотрудник, Лаборатория новых методов в биологии,
Институт биологического приборостроения с опытным производством РАН, Пущино, Россия
2003-2010: научный сотрудник, Лаборатория клеточной нейробиологии,
Институт биофизики клетки РАН, Пущино, Россия
2003–2004: стажировка в университете г. Лунда, госпиталь при университете г. Мальмё,
кафедра лабораторной медицины, группа медицинской микробиологии, Мальмё, S-205 02, Швеция
2002-2006: стажировка в лаборатории клинической иммунологии 
ФГБУ «Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии им. академика В.И. Кулакова Минздрава России»
2001-2003: старший лаборант-исследователь,
 Лаборатория клеточной нейробиологии, Институт биофизики клетки РАН, Пущино, Россия 

Бобкова Наталья Викторовна,  кандидат биологических наук

Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.

Преподаваемая дисциплина: Нейродегенеративные заболевания

Зав. лабораторией: Лаборатория клеточных механизмов патологии памяти Института биофизики клетки РАН

Научные интересы: моделирование нейродегенеративных заболеваний для исследования их патогенеза и разработки средств направленной терапиии

Основные публикации за последние 5 лет:
1. Natalia Bobkova, Irina Guzhova, Boris Margulis, Inna Nesterova, Natalia Medvinskaya, Alexander Samokhin, Irina Alexandrova, David Garbuz, Evgeny Nudler, Michael Evgen’ev. Dynamics of endogenous Hsp70 synthesis in the brain of olfactory bulbectomized mice. Cell Stress Chaperones. 2013; 18(1):109-118
2. N. V. Bobkova, R. A. Poltavtseva, A. N. Samokhin, and G. T. Sukhikh Therapeutic Effect of Mesenchymal Multipotent Stromal Cells on Memory in Animals with Alzheimer-Type Neurodegeneration. Cell Technologies in Biology and Medicine, 2013, No. 2, p.119-121.
3. Bobkova NV, Medvinskaya NI, Kamynina AV, Aleksandrova IY, Nesterova IV, Samokhin AN, Koroev DO, Filatova MP, Nekrasov PV, Abramov AY, Leonov SV, Volpina OM. Immunization with either prion protein fragment 95-123 or the fragment-specific antibodies rescue memory loss and neurodegenerative phenotype of neurons in olfactory bulbectomized mice. Neurobiol Learn Mem. 2014; 107:50-64
4. Bobkova NV, Garbuz DG, Nesterova I, Medvinskaya N, Samokhin A, Alexandrova I, Yashin V, Karpov V, Kukharsky MS, Ninkina NN, Smirnov AA, Nudler E, Evgen'ev M. Therapeutic effect of exogenous hsp70 in mouse models of Alzheimer's disease. J Alzheimers Dis. 2014; 38(2):425-35
5. Панченко М.М., Полтавцева Р.А., Бобкова Н.В., Вельмешев Д.В., Нестерова И.В., Самохин А.Н., Сухих Г.Т. Локализация и характер дифференцировки трансплантированных мезенхимальных мультипотентных стромальных клеток человека в мозге бульбэктомированных мышей. Клеточные технологии в биологии и медицине, 2014, №3, 139-145.
6. А.Н.Кленяева, Р.Н.Чупров-Неточин, Е.И.Марусевич, О.Г.Татарникова, М.А.Орлов, Н.В.Бобкова Получение культуры клеток фибробластов мыши с постоянным уровнем экспрессии белка тау человека и изучение тау зависимой цитотоксичности. Биологические мембраны, 2014, т.31, №3, с.1-10.
7. Н.В.Бобкова, М.Б.Евгеньев. «Изучение динамики нейродегенерации и компенсаторных механизмов у бульбектомированных животных». Глава в Монографии: Нейродегенеративные заболевания: от генома до целостного организма. под ред. акад. М.В. Угрюмова. – М. : Научный мир, 2014. – в 2-х томах – ISBN 4356 , т.2. стр.380-404.
8. Bobkova NV, Evgen'ev M, Garbuz DG, Kulikov AM, Morozov A, Samokhin A, Velmeshev D, Medvinskaya N, Nesterova I, Pollock A, Nudler E. Exogenous Hsp70 delays senescence and improves cognitive function in aging mice. // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (P NATL ACAD SCI USA, Proc Natl Acad Sci USA), 2015. — Vol. 112, — № 52. — P. 16006-16011
9. Bobkova N.V., Lyabin D.N., Medvinskaya N.I., Samokhin A.N., Nekrasov P.V., Nesterova I.V., Aleksandrova I.Y., Tatarnikova O.G., Bobylev A.G., Vikhlyantsev I.M., Kukharsky M.S., Ustyugov A.A., Polyakov D.N., Eliseeva I.A., Kretov D.A., Guryanov S.G., Ovchinnikov L.P. The Y-box Binding Protein 1 Suppresses Alzheimer’s Disease Progression in Two Animal Models // PloS one, 2015. — Vol. 10, — № 9. — P. e0138867
10. Tatarnikova O.G., Orlov M.A., Bobkova N.V. Beta-amyloid and Tau-protein: Structure, Interaction, and Prion-like Properties // BIOCHEMISTRY (MOSCOW). Biokhimiya, 2015. — Vol. 80, — № 13. — P. 1800-1819
11. Bobkova N, Vorobyov V The brain compensatory mechanisms and Alzheimer’s disease progression: a new protective strategy // Neural Regeneration Research, 2015. — Vol. 10, — № 5. — P. 696-697
12. Bobkova N, Vorobyov V, Medvinskaya N, Nesterova I, Tatarnikova O, Nekrasov P, Samokhin A, Deev A, Sengpiel F, Koroev D, Volpina O Immunization against specific fragments of neurotrophin p75 receptor protects forebrain cholinergic neurons in the olfactory bulbectomized mice // Journal of Alzheimer's Disease, 2016. — Vol. 53, — № 1. — P. 289-301
13. Avetisyan AV, Samokhin AN, Alexandrova IY, Zinovkin RA, Simonyan RA, Bobkova NV. Mitochondrial Dysfunction in Neocortex and Hippocampus of Olfactory Bulbectomized Mice, a Model of Alzheimer's Disease. // БИОХИМИЯ, 2016. — Vol. 81, — № 6. — P. 615-623
14. Д.О. Короев, О.М. Вольпина, Т.Д. Волкова, А.В. Камынина, М.П. Филатова, С.М. Баласанянц, А.Н. Самохин, Н.В. Бобкова Синтетический фрагмент 60–70 рецептора конечных продуктов гликозилирования проявляет терапевтическую активность в животной модели болезни Аальцгеймера // Биоорганическая химия, 2017, том 43, № 2, с. 174–179
15. V. Vorobyov, N. Bobkova Intracerebral interplay and neurotransmitter systems involvement in animal models of neurodegenerative disorders: EEG approach expectations // Neural regeneration research 2017,Volume 12,Issue 1: 66-67.
16. Г.Ф. Иваненко, Н.В. Бобкова Состояние глутатиона в плазме крови у животных при развитии экспериментальной патологии, моделирующей нейродегенерацию альцгеймеровского типа // Биофизика 2017 (в печати)
17. Tamara Voronina, Nikolay Grechko, Alla I. Shikhlyarova,  Natalia Bobkova Intermittent hypoxic training as an effective method of activation therapy // Cardiometry 2017 issue 10: 93-99 . DOI: 10.12710/cardiometry.2017.9399

Рогачевская Ольга Анатольевна,  кандидат биологических наук

Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.

Преподаваемая дисциплина:

Ведущий научный сотрудник Института биофизики клетки РАН

Научные интересы: рецепция, вкусовая сенсорная система, внутриклеточная сигнализация, культура клеток, экспрессия генов

Основные публикации за последние 5 лет:
1. Romanov R.A., Bystrova M.F., Rogachevskaja O.A., V.B. Sadovnikov, V.I. Shestopalov, Kolesnikov S.S. Dispensable ATP permeability of Pannexin 1 channels in a heterologous system and in mammalian taste cells. // J. Cell Sci. 2012. 125. Р.5514-23.
2. Andreev Y.A., Kozlov S.A., Korolkova Y.V., Dyachenko I.A., Bondarenko D.A., Skobtsov D.I., Murashev A.N., Kotova P.D., Rogachevskaja O.A., Kabanova N.V., Kolesnikov S.S., Grishin E.V. Polypeptide modulators of TRPV1 produce analgesia without hyperthermia. // Marine Drugs. 2013, 11(12):5100-15. doi: 10.3390/md11125100.
3. Kotova P.D., Sysoeva V.Y., Rogachevskaja O.A., Bystrova M.F., Kolesnikova A.S., Tyurin-Kuzmin P.A., Fadeeva J.I., Tkachuk V.A., Kolesnikov S.S. Functional expression of adrenoreceptors in mesenchymal stromal cells derived from the human adipose tissue. // BBA, 2014. 1843, 1899-1908.
4. Cherkashin A.P., Kolesnikova A.S., Tarasov M.V., Romanov R.A., Rogachevskaja O.A., Bystrova M.F., Kolesnikov S.S. Expression of calcium-activated chloride channels Ano1 and Ano2 in mouse taste cells. // Pflugers Arch. 2016. 468(2):305-19. DOI 10.1007/s00424-015-1751-z
5. Tarasov M.V., Bystrova M.F., Kotova P.D., Rogachevskaja O.A., Sysoeva V.Y., Kolesnikov S.S. Calcium-gated K+ channels of the KCa1.1- and KCa3.1-type couple intracellular Ca2+ signals to membrane hyperpolarization in mesenchymal stromal cells from the human adipose tissue. // Pflügers Archiv - European Journal of Physiology. 2017. 469(2):349–362.

Образование:

Нижегородский государственный университет имени Н.И. Лобачевского, 1997г., бакалавр биологии;
Пущинский государственный университет, 1999г., магистр биологии;

Стаж работы преподавателем: 1,5 года

Премии и награды: победитель конкурса работ молодых ученых г. Пущино, 2008-2010гг; призер конкурса научных работ Института биофизики клетки РАН, 2009-2014гг;
Победы в грантах и научных проектах: грант Президента РФ для поддержки молодых ученых – кандидатов наук; ФЦП «Научные и педагогические кадры инновационной России», ГК № П809; соглашение №8782, Министерство образования и науки Российской Федерации; РФФИ 14-04-01711 и 17-04-01941

Индекс Хирша: 8

Краткая трудовая биография:

1994-1997 г. Нижний Новгород, Нижегородская медицинская академия, лаборант лаборатории электронной микроскопии ЦНИЛ;
1997-по настоящее время - г. Пущино, М/О, Институт биофизики клетки РАН, последовательно магистрант (лаборант-исследователь), аспирант научной группы «Клетка», затем младший научный сотрудник, старший научный сотрудник, ведущий научный сотрудник в лаборатории «Молекулярная физиология клетки».

Асташев Максим Евгеньевич, кандидат биологических наук

Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.

Преподаваемая дисциплина: Клеточный электрогенез

Старший научный сотрудник Института биофизки клетки РАН

Научные интересы: ионные каналы и ионотропные рецепторы, цифровая обработка сигналов, системное программирование, автоматизация эксперимента.

Основные публикации за последние 5 лет:

1. Vulfius C.A., Kasheverov I.E., Starkov V.G., Osipov A.V., Andreeva T.V., Filkin S.Yu., Gorbacheva E.V., Astashev M.E., Tsetlin V.I., Utkin Y.N. Inhibition of nicotinic acetylcholine receptors, a novel facet in the pleiotropic activities of snake venom phospholipases A2. PLoS One. 2014, Dec 18; 9(12):e115428. doi: 10.1371/journal.pone.0115428.
2. Aminin D., Pislyagin E., Astashev M., Es’kov A., Kozhemyako V., Avilov S, Zelepuga E., Yurchenko E., Kaluzhskiy L., Kozlovskaya E., IvanovA. & Stonik V. Glycosides from edible sea cucumbers stimulate macrophages via purinergic receptors. Scientific Reports 6, Article number: 39683 (2016). doi:10.1038/srep39683.
3. Belosludtsev K.N., Belosludtseva N.V., Agafonov A.V., Astashev M.E., Kazakov A.S., Saris N.-E.L., Mironova G.D. Ca2+-dependent permeabilization of mitochondria and liposomes by palmitic and oleic acids: A comparative study. Biochimica et Biophysica Acta 2014. V.1838. P. 2600–2606.
4. Astasheva E., Astashev M., Kitchigina V., Changes in the behavior and oscillatory activity in cortical and subcortical brain structures induced by repeated l-glutamate injections to the medial septal area in guinea pigs, Epilepsy Research, 2015; V. 109. P. 134-145.
5. Dubinin M.V., Astashev M.E., Penkov N.V., Gudkov S.V., Dyachenko I.A., Samartsev V.N., Belosludtsev K.N. Effects of phospholipase A2 inhibitors on bilayer lipid membranes. Journal of Membrane Biology, 2016, v.249(3), p.339–347.
6. Astashev M.E., Belosludtsev K.N., Kharakoz D.R., Method for digital measurement of phase-frequency characteristics for a fixed-length ultrasonic spectrometer, Acoustical Physics, 2014; V. 60, I. 3, P. 335–341.
7. Gudkov S.V., Astashev M.E., Bruskov V.I., Kozlov V.A., Zakharov S.D., and Bunkin N.F. Self-oscillating water chemiluminescence modes and reactive oxygen species generation induced by laser irradiation: effect of the exclusion zone created by nafion. Entropy, 2014, V.16(11), P.6166-6185.

Образование:

Ростовский государственный университет (ныне ЮФУ), 2001 год, бакалавриат, физический факультет, физика;
Пущинский государственный университет, 2003 год, магистратура, Биология клетки, Биология,
Основная очная аспирантура РАН, Институт биофизики клетки РАН, 2006 год.

Стаж работы преподавателем: 5 лет

Индекс Хирша: 6

Краткая трудовая биография:
Асташев Максим Евгеньевич – кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории клеточной нейробиологии Института биофизики клетки РАН г. Пущино. В 2001 году окончил физический факультет (направление – физика) Ростовского государственного университета (ныне ЮФУ). В 2001 году приехал в Пущино Московской области, поступил в магистратуру Пущиноского государственного университета и начал научную работу под руководством д.ф.-м.н Казаченко Владимира Николаевича, которая касалась экспериментального исследования внутримолекулярной динамики воротного механизма одиночных К+-каналов. В 2003 году Асташев М.Е. получил диплом с отличием магистра биологии и поступил в основную очную аспирантуру Института биофизики клетки РАН. В 2008 году он защитил диссертацию на соискание степени кандидата биологических наук по теме «Мультифрактальность в активности одиночных К+-каналов» по специальности «Биофизика». За время трудовой деятельности в ИБК РАН Асташев М.Е. участвовал в создании нескольких лабораторных установок: Ультразвукового спектрометра фиксированной длины, Автономного регистратора геофизических характеристик для работы на Северном полюсе Земли, установки пэтч-кламп, флуоресцентной имэджинг-станции для регистрации внутриклеточного кальция, ЭЭГ для работы с подвижными животными, комплекса регистрации физиологических показателей животных (ЭКГ, дыхание, температура тела, показатель микроциркуляции), изолированной камеры для длительной передержки животных в условиях контролируемой атмосферы. Также за время трудовой деятельности в ИБК РАН Асташев М.Е. участвовал в реализации нескольких научных проектов: изучение эффекта долговременной памяти в воротном механизме одиночного ионного канала, изучение молекулярного механизма действия иммуностимуляторов, опосредованного пуриновыми рецепторами, изучение физико-химических свойств липидных слоев и суспензий, изучение микроциркуляторного русла у животных, изучение ритмических процессов в различных биологических и физико-химических системах.
Асташев М.Е. является специалистом в клеточной электрофизиологии, физиологии клеток врожденного иммунитета, цифровой обработке нестационарных сигналов, цифровым системам сбора экспериментальных данных, автоматизации биологического эксперимента, проектировании научного оборудования.

Мальцева Валентина Николаевна, кандидат биологических наук

Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.

Преподаваемая дисциплина: Физиология клеток иммунной системы

Научный сотрудник Института биофизки клетки РАН

Научные интересы:  Изучение функциональной активности и внутриклеточной сигнализации клеток иммунной и нервной системы, их модификации при патологических процессах, иммунология, онкоиммунология, биофизика, внутриклеточная сигнализация

Основные публикации за последние 5 лет:

Safronova V.G., Vulfius C.A., Shelukhina I.V., Mal'tseva V.N., Berezhnov A.V., Fedotova E.I., Miftahova R.G., Kryukova E.V., Grinevich A.A., Tsetlin V.I. Nicotinic receptor involvement in regulation of functions of mouse neutrophils frominflammatory site. Immunobiology. 2016. V. 221. No 7. P. 761-772.

Образование (что окончил, когда, направление/специальность):

1997-2002 Удмуртский государственный университет, факультет Медицинская биотехнология, биохимик

2002-2004 Пущинский государственный университет, факультет Биология клетки, магистратура

2004-2007 Институт биофизики клетки, аспирантура, 2007 году защитила диссертацию по специальности 03.00.02 «биофизика»

Стаж работы преподавателем:

2008-2017, 9 лет

Премии и награды:

лауреатом Благотворительного Фонда содействия отечественной науке по программе "Лучший аспирант РАН"

Победы в грантах и научных проектах:

- гранты РФФИ, НШ, грант Шведского Института (Swedish Institute, grant Dr. A. Bredberg, Lund University, Sweden

- Travel Young Grant EMBO / FEBS для участия в Специализированной FEBS  Конференции  (Бельгия, Брюссель)

- Travel Young Grant EMBO / FEBS для участия в школе-конференции "Молекулярные механизмы в передаче сигнала и рак» (Греция)

Индекс Хирша: 6

Краткая трудовая биография:

Опыт работы с 2001 года, совмещала  учебу в Удмуртском государственном университете с работой лаборанта на кафедре иммунологии.

С 2002 года работала в лаборатории клеточной нейробиологии Института биофизики клетки РАН сначала в должности лаборанта, затем научного сотрудника. Участвовала в работе Летней школы для американских студентов (Пущинский Научный Центр, 2003-2009), обучая участников школы основам иммунологии и методам экспериментальной биологии.  В 2008-2009 г.г. принимала участие в качестве руководителя и эксперта секции "Физиология животных и биомедицина" Международной Пущинской школы-конференции молодых ученых «БИОЛОГИЯ – НАУКА XXI ВЕКА».

В 2009 году перешла на работу в институт Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАН в лабораторию клеточной инженерии в должности научного сотрудника.

С 2008 года по настоящее время являюсь доцентом учебного центра «Биология клетки» Пущинского государственного естественно-научного  института. Разработала и преподаю специальный курс «Физиология клеток иммунной системы» для магистрантов.

Тутукина Мария,  кандидат биологических наук

Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.

Преподаваемая дисциплина:

Научный сотрудник Института биофизки клетки РАН

Scientific interests: Functional and comparative genomics of bacteria, Untranslated RNAs and their evolution; evolution of bacterial genomes, Transcriptional regulation, Bioinformatics and computational biology.

Education
2009 PhD in Molecular Biology, Institute of Cell Biophysics RAS, Pushchino, Moscow
2006-2009 PhD Student at the Department of Functional Genomics and Cellular Stress, Institute of Cell Biophysics Russian Academy of Sciences
2000-2006 Student of Voronezh State University, Faculty for Biology and Soil Science
2006 MSc in Biochemistry, Department of Cell Biochemistry and Physiology, VSU, Voronezh, Russia, and Department of Functional Genomics and Cellular Stress, Institute of Cell Biophysics RAS, Pushchino, Russia.
2004 BSc in Biochemistry, Department of Cell Biochemistry and Physiology, VSU, Voronezh, Russia (1st Class Honour degree)
In parallel:
2003-2006 Student of Voronezh State University, Faculty for Chemistry
2006 Diploma in Physical Chemistry (1st Class Honour degree). 

Honours/Awards

1st prize winner of the IХ International Conference «Biology is the science of ХХI century» (Pushchino, Russia, 2005) (Talk)

EMBO award for the outstanding poster presentation on the Conference “Genomes 2008: Functional genomics of microorganisms” (Paris, France, 2008).

Grants/Fellowships
(2014) PI of the RFBR research grant 15-04-08716
(2012) PI of the RFBR research grant 12-04-01830
(2010-2011) FEMS research fellowship (FRF 2010-2)
(2013, 2011, 2009, 2008) FEMS young scientist grants
(2010, 2009, 2008) RFBR travel grants
(2010, 2008) EMBL Conference “From Functional genomics to systems biology” travel fellowship; EMBL-Heidelberg, Germany
(2010) Robert-Bosch-Stiftung Fellowship for the EMBO Meeting 2010; Barcelona, Spain
(2009) 34th FEBS Congress travel fellowship; Prague, Czech Republic

Internships and collaborations
(2011-present) Laboratory of Molecular Microbiology, School of Biosciences, University of Birmingham, UK (Prof. Jeff Cole, Prof. Steve Busby, Dr. Dave Grainger)
(2013-present) Evolutionary Genomics, Bioinformatics and Genomics Programme, Centre for Genomic Regulation-CRG, Barcelona, Spain (Dr. Fyodor Kondrashov)

Research experience
General gene engineering techniques such as DNA and RNA purification, PCR, qRT-PCR, RACE, molecular cloning and sequencing of DNA, RNA-seq;
Promoter activity testing in vitro and in vivo;
Western, Southern and Northern blotting analysis;
Chromatin immunoprecipitation, ChIP-seq;
Protein expression in E. coli and its purification;
Methods of bioenergetics;
Electrochemical methods (voltammetry, rotating disk electrode technique);
Computer modelling and comparative genomics.

Teaching experience
2014-present lecture course: "Molecular methods in Cell biology ", Pushchino State Institute
2012-2016 Courses on biochemistry and molecular biology at the School of Theoretical and Molecular Biology (Pushchino, 2012-2015, Barcelona, 2016)

Supervising: 1 PhD project (defended in 2016) and 2 MS projects (2013-2014 and 2016-2017)

Membership
FEMS
FEBS
Interregional Russian Microbiological Society

List of publications

1. MV Zakharchenko, AV Zakharchenko, NV Khunderyakova, MN Tutukina, MA Simonova, AA Vasilieva, OI Romanova, NI Fedotcheva, EG Litvinova, EI Maevsky, VP Zinchenko, AV Berezhnov, IG Morgunov, AA Gulayev, MN Kondrashova Burst of succinate dehydrogenase and α-ketoglutarate dehydrogenase activity in concert with the expression of genes coding for respiratory chain proteins underlies short-term beneficial physiological stress in mitochondria. // The International Journal of Biochemistry and Cell Biology – 2012 - http://dx.doi.org/10.1016/j.biocel.2012.07.003
2. I. V. Trubitsyn, Zh. G. Andreevskikh, L. I. Yurevich, E. V. Belousova, M. N. Tutukina, А.Y. Merkel, G. A. Dubinina, M. Yu. Grabovich Capacity for nitrate respiration as a new aspect of metabolism of the filamentous sulfur bacteria of the genus Thiothrix.// Microbiology. – 2013 – V.82, №1. – p.15-21.
3. Potapova A.V., Ozoline O.N., Tutukina M.N. Development of effective overproduction and purification approaches for the ExuR transcription factor of Escherichia coli.// Sorption and Chromatographic Processes – 2014- 14 (3). – p. 537-543. (In Russian)
4. Yu.A. Purtov, O.A. Glazunova, S.S. Antipov, V.O. Pokusaeva, E.E. Fesenko, E.V. Preobrazhenskaya, K.S. Shavkunov, M.N. Tutukina, V.I. Lukyanov, O.N. Ozoline Promoter islands as a platform for interaction with nucleoid proteins and transcription factors // J. of Bioinf. and Comp. Biology – 2014
5. Trubitsyn I.V., Belousova E.V., Tutukina M.N., Merkel A.Yu., Dubinina G.A., Grabovich M.Yu. Expansion of ability to anaerobic respiration on nitrates within the filamentous colourless sulphur bacteria of the genus Thiothrix. // FEMS Microbiol Lett. – 2014 -Sep;358(1):72-80. doi: 11.1111/1574-6968.12548.
6. Krivushin K, Kondrashov F, Shmakova L, Tutukina M, Petrovskaya L, Rivkina E. Two metagenomes from late pleistocene northeast siberian permafrost. // Genome Announc. -2015 -Jan 2;3(1). pii: e01380-14. doi: 10.1128/genomeA.01380-14.
7. Melekhov VV, Shvyreva US, Timchenko AA, Tutukina MN, Preobrazhenskaya EV, Burkova DV, Artiukhov VG, Ozoline ON, Antipov SS. Modes of Escherichia coli Dps Interaction with DNA as Revealed by Atomic Force Microscopy. // PLoS One. – 2015 - May 15;10(5):e0126504. doi: 10.1371/journal.pone.0126504.
8. Shvyreva U.S., Tutukina M.N. Ozoline O.N. «Promoter islands» of the E. coli genome as targets for sorption of the RNA processing enzymes. // Sorption and Chromatographic Processes- 2015 -Т. 15. № 4. – p. 586-594.
9. Tutukina M.N., Shvyreva U.S., Ozoline O.N. Architectural factor of bacterial nucleoid, H-NS: overproduction and verification of its functional activity. // Sorption and Chromatographic Processes- 2015 - Т. 15. № 3. – p. 435-442.
10. Tutukina MN, Potapova AV, Vlasov PK, Purtov YA, Ozoline ON. Structural Modeling of the ExuR and UxuR Transcription Factors of E. coli: Search for the Ligands Affecting their Regulatory Properties. // J Biomol Struct Dyn. – 2016 - Oct;34(10):2296-304. doi: 10.1080/07391102.2015.1115779.
11. Tutukina MN, Potapova AV, Cole JA, Ozoline ON. Control of hexuronate metabolism in Escherichia coli by the two interdependent regulators, ExuR and UxuR: derepression by heterodimer formation. // Microbiology. – 2016 - Jul;162(7):1220-31. doi: 10.1099/mic.0.000297.
12. Orlova MV, Tarlachkov SV, Dubinina GA, Belousova EV, Tutukina MN, Grabovich MY. Genomic insights into metabolic versatility of a lithotrophic sulfur-oxidizing diazotrophic Alphaproteobacterium Azospirillum thiophilum. // FEMS Microbiol Ecol. – 2016 - Dec;92(12). pii: fiw199.
13. Bessonova T.A., Shumeyko S.A., Purtov Yu. A., Antipov S.S., Preobrazhenskaya E.V., Tutukina M.N., Ozoline O.N. Hexuronates influence the oligomeric form of the Dps structural protein of bacterial nucleoid and its ability to bind linear DNA fragments.// Biofizika – 2016 – 61(6) – p. 1059-1067.
14. Elizaveta Rivkina, Lada Petrovskaya, Tatiana Vishnivetskaya, Kirill Krivushin, Lyubov Shmakova, Maria Tutukina, Arthur Meyers, Fyodor Kondrashov. Metagenomic analyses of the late Pleistocene permafrost – additional tools for reconstruction of environmental conditions // Biogeosciences – 2016 – 13 – p. 2207-2219. doi:10.5194/bg-13-2207-2016